More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1407 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  100 
 
 
388 aa  772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  62.4 
 
 
405 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  55.15 
 
 
395 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  51.55 
 
 
423 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  47.07 
 
 
406 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  47.07 
 
 
406 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  47.07 
 
 
406 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  46.95 
 
 
406 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  44.94 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  44.84 
 
 
406 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  44.16 
 
 
399 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  44.53 
 
 
395 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  43.6 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  42.26 
 
 
430 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  41.06 
 
 
423 aa  272  9e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  41.24 
 
 
421 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.34 
 
 
400 aa  259  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.57 
 
 
399 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.65 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  39.02 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  36.86 
 
 
408 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  41.08 
 
 
410 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  39.7 
 
 
408 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  41.71 
 
 
394 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.9 
 
 
402 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  40.05 
 
 
436 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  41.38 
 
 
357 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  38.17 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  38.4 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  39.45 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  38.9 
 
 
416 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.12 
 
 
394 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  38.18 
 
 
400 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  42.32 
 
 
345 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  38.6 
 
 
408 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.8 
 
 
403 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  37.99 
 
 
409 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.58 
 
 
400 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.4 
 
 
415 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  34.88 
 
 
405 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  39.11 
 
 
400 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.63 
 
 
398 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.33 
 
 
407 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.33 
 
 
407 aa  222  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  37.82 
 
 
404 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.12 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  36.72 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.59 
 
 
412 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  33.07 
 
 
409 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  36.13 
 
 
408 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.4 
 
 
400 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.97 
 
 
397 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  37.12 
 
 
400 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.44 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.6 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.69 
 
 
411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.7 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  35.16 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.25 
 
 
391 aa  212  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  33.07 
 
 
409 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  39.26 
 
 
397 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  33.51 
 
 
393 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.88 
 
 
395 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.26 
 
 
411 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  35.77 
 
 
409 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  36.45 
 
 
404 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.53 
 
 
408 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  38.52 
 
 
395 aa  205  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.86 
 
 
400 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  34 
 
 
400 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  32.8 
 
 
412 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  32.8 
 
 
412 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  33.25 
 
 
407 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.05 
 
 
417 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  32.8 
 
 
412 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.39 
 
 
411 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.15 
 
 
407 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.48 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.25 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  38.76 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.25 
 
 
419 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.34 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.95 
 
 
400 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.11 
 
 
398 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  35.14 
 
 
402 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  38.28 
 
 
404 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.48 
 
 
426 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  33.24 
 
 
409 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.36 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  33.42 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  35.77 
 
 
425 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.73 
 
 
398 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.87 
 
 
411 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  35.55 
 
 
413 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  32.63 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  32.63 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  32.63 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  32.74 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.6 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>