More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1731 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  100 
 
 
407 aa  818    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  59.15 
 
 
401 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  57.57 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  56.75 
 
 
400 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  54.59 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  54.8 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  55.78 
 
 
399 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  55.03 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  53.83 
 
 
400 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  51.79 
 
 
401 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  51.13 
 
 
408 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  51.87 
 
 
400 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  49.75 
 
 
395 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  52.03 
 
 
410 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  49.36 
 
 
408 aa  363  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  47.98 
 
 
430 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  47 
 
 
421 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  44.95 
 
 
397 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.85 
 
 
409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  45.96 
 
 
409 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  43.86 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  42.54 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  44.99 
 
 
414 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  51.44 
 
 
357 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  45.8 
 
 
399 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  42.86 
 
 
407 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  43.41 
 
 
402 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  48.56 
 
 
345 aa  289  6e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  41.11 
 
 
400 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.92 
 
 
404 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  43.22 
 
 
406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  43.22 
 
 
406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  43.22 
 
 
406 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  41.5 
 
 
415 aa  272  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  38.5 
 
 
409 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  42.05 
 
 
399 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  40.45 
 
 
398 aa  270  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.33 
 
 
403 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  40.3 
 
 
407 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.86 
 
 
406 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  39.55 
 
 
421 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  39.55 
 
 
421 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  39.55 
 
 
421 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.07 
 
 
394 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  38 
 
 
409 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  39.37 
 
 
412 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  39.37 
 
 
412 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  39.37 
 
 
412 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  42.68 
 
 
400 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.53 
 
 
408 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  41.77 
 
 
417 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.56 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.56 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.36 
 
 
401 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  41.94 
 
 
406 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.49 
 
 
398 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  39.9 
 
 
416 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  38.85 
 
 
409 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  39.71 
 
 
424 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.5 
 
 
394 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.94 
 
 
405 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  40.2 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  37.75 
 
 
415 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  39.9 
 
 
405 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  38.28 
 
 
407 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  40.71 
 
 
395 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.68 
 
 
408 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  38.36 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.99 
 
 
391 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  43.16 
 
 
397 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.85 
 
 
388 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.49 
 
 
412 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  39.68 
 
 
423 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  39.29 
 
 
404 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.69 
 
 
410 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.82 
 
 
423 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.68 
 
 
395 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.99 
 
 
400 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  37.06 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.15 
 
 
401 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.25 
 
 
406 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.18 
 
 
402 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.96 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.38 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.21 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  36.79 
 
 
393 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.83 
 
 
400 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  36.43 
 
 
375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.24 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38 
 
 
426 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.41 
 
 
402 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  38.03 
 
 
395 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.45 
 
 
405 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.11 
 
 
400 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  36.17 
 
 
397 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.67 
 
 
419 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  33.97 
 
 
411 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  35.82 
 
 
412 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  34.26 
 
 
396 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  35.19 
 
 
404 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>