More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4832 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  820    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  67.57 
 
 
408 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  64.13 
 
 
410 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  59.06 
 
 
401 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  54.95 
 
 
401 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  54.68 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  54.43 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  54.06 
 
 
400 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  53.22 
 
 
399 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  51.13 
 
 
407 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  51.39 
 
 
399 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  52.07 
 
 
395 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  51.39 
 
 
400 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  50.88 
 
 
436 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  48.74 
 
 
400 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  51.54 
 
 
399 aa  352  8e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  48.6 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  51.36 
 
 
406 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  51.36 
 
 
406 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  51.36 
 
 
406 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  48.23 
 
 
414 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  49.63 
 
 
394 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  46.63 
 
 
399 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  45.94 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  45.75 
 
 
409 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  47.24 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  46.06 
 
 
402 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  49.28 
 
 
345 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  45.97 
 
 
409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  47.63 
 
 
357 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  43.54 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  45.13 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  46.56 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  45.61 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  42.51 
 
 
407 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  42.51 
 
 
407 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  44.53 
 
 
405 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  45.13 
 
 
404 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  42.45 
 
 
407 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  43.7 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  41.9 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  41.91 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  40.54 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  41.87 
 
 
409 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  42.64 
 
 
408 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  41.84 
 
 
407 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  41.52 
 
 
409 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  42.09 
 
 
413 aa  276  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  40.29 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  44.27 
 
 
400 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.45 
 
 
394 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.13 
 
 
405 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  39.74 
 
 
405 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  41.53 
 
 
412 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  41.53 
 
 
412 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  41.27 
 
 
412 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  42.61 
 
 
404 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  38.93 
 
 
421 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  38.93 
 
 
421 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  38.93 
 
 
421 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  38.39 
 
 
411 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  42.37 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  39.4 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  38.13 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.91 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.87 
 
 
424 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  36.86 
 
 
388 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.74 
 
 
423 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  43.67 
 
 
397 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  39.27 
 
 
406 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.33 
 
 
412 aa  245  9e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  42.64 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  39.13 
 
 
393 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  39.49 
 
 
423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.56 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.11 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.1 
 
 
405 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.37 
 
 
402 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  36.7 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  36.86 
 
 
415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.46 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.44 
 
 
395 aa  233  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.96 
 
 
411 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  37.83 
 
 
401 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.63 
 
 
417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.14 
 
 
400 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.4 
 
 
375 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.77 
 
 
407 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.34 
 
 
406 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.92 
 
 
408 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.25 
 
 
402 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  38.95 
 
 
395 aa  223  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.15 
 
 
414 aa  222  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.62 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.96 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.52 
 
 
412 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.84 
 
 
404 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  38.24 
 
 
397 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.11 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.44 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>