More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  79.95 
 
 
408 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  824    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  68.22 
 
 
407 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  63.13 
 
 
407 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  60.15 
 
 
405 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  52.21 
 
 
409 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  51.96 
 
 
409 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  53.14 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  53.14 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  52.9 
 
 
412 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  50.87 
 
 
421 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  50.87 
 
 
421 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  50.87 
 
 
421 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  51.5 
 
 
400 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  47.12 
 
 
408 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  52.23 
 
 
403 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  49 
 
 
416 aa  358  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  49.88 
 
 
399 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  47.99 
 
 
404 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  49.13 
 
 
398 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  47.58 
 
 
407 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  47.58 
 
 
407 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  48.59 
 
 
401 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  50.74 
 
 
395 aa  338  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  48.17 
 
 
401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  48.76 
 
 
400 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  47.3 
 
 
408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  47.49 
 
 
404 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  45.66 
 
 
406 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  45.41 
 
 
430 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  47.75 
 
 
410 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  46.65 
 
 
400 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  45.43 
 
 
405 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.78 
 
 
424 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  44.61 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  44.85 
 
 
407 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  45.97 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  46.92 
 
 
399 aa  311  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  43.98 
 
 
399 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  43.55 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  46.46 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  44.69 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  44.1 
 
 
410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  42.92 
 
 
415 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  44.3 
 
 
400 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  43.63 
 
 
400 aa  295  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  44.07 
 
 
411 aa  295  9e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  44.16 
 
 
399 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  44.5 
 
 
402 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  42.22 
 
 
421 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.93 
 
 
406 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  44.06 
 
 
375 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  43.14 
 
 
436 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  43.95 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  40.89 
 
 
404 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  41.06 
 
 
406 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  41.06 
 
 
406 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  48.73 
 
 
357 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  41.06 
 
 
406 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  41.71 
 
 
407 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  44.19 
 
 
409 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  40.29 
 
 
415 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.48 
 
 
398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  42.2 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.18 
 
 
394 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  46.18 
 
 
345 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  40.65 
 
 
397 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.75 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.29 
 
 
394 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  42.03 
 
 
408 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  37.65 
 
 
401 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.75 
 
 
391 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  41.54 
 
 
423 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  39.6 
 
 
401 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.33 
 
 
402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.95 
 
 
410 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  41.4 
 
 
399 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  42.71 
 
 
398 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.76 
 
 
405 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.36 
 
 
417 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.1 
 
 
411 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.73 
 
 
412 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  41.1 
 
 
395 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.56 
 
 
393 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.76 
 
 
411 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.18 
 
 
411 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40.11 
 
 
400 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.76 
 
 
405 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.38 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.67 
 
 
406 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.21 
 
 
395 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.41 
 
 
411 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  37.38 
 
 
403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  35.47 
 
 
425 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.89 
 
 
420 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.9 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.01 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.64 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  38.98 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.87 
 
 
397 aa  219  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>