More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0945 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  100 
 
 
410 aa  846    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  48.33 
 
 
408 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  45.11 
 
 
405 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  44.67 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  43.34 
 
 
404 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.1 
 
 
409 aa  322  7e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  42.51 
 
 
403 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  44.95 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  39.76 
 
 
406 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  41.96 
 
 
407 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  41.46 
 
 
395 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  41.38 
 
 
407 aa  290  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  40.25 
 
 
409 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  39.35 
 
 
409 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  38.85 
 
 
409 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  39.54 
 
 
421 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  39.54 
 
 
421 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  39.54 
 
 
421 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  39.7 
 
 
416 aa  279  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  41.19 
 
 
399 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  38.96 
 
 
408 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  38.54 
 
 
405 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  41.44 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.83 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.57 
 
 
407 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.57 
 
 
407 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  38.83 
 
 
412 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  38.83 
 
 
412 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.4 
 
 
408 aa  270  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  41.84 
 
 
399 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  38.56 
 
 
412 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  40.8 
 
 
404 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  38.08 
 
 
415 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.06 
 
 
424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.66 
 
 
408 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  39.11 
 
 
400 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.7 
 
 
401 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  37.84 
 
 
407 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.76 
 
 
405 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.04 
 
 
406 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.04 
 
 
406 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.04 
 
 
406 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.66 
 
 
398 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  37.69 
 
 
407 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.82 
 
 
400 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  37.32 
 
 
397 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  39.12 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.31 
 
 
430 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  38.52 
 
 
409 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.5 
 
 
398 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  36.91 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  39.31 
 
 
410 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.51 
 
 
411 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.28 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  36.32 
 
 
421 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.53 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.5 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.91 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.93 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  36.36 
 
 
415 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.72 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  34.24 
 
 
401 aa  232  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  40.82 
 
 
345 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.48 
 
 
419 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  37.31 
 
 
414 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.73 
 
 
423 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.11 
 
 
412 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  40.19 
 
 
357 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  38.99 
 
 
404 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  36.17 
 
 
400 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.3 
 
 
411 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  37.37 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  38.07 
 
 
403 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  37.63 
 
 
400 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.32 
 
 
411 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.41 
 
 
402 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  39.69 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  35.52 
 
 
375 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.07 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.38 
 
 
399 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.35 
 
 
417 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  35.16 
 
 
405 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.27 
 
 
426 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.42 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.88 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  37.28 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  37.25 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  35.6 
 
 
436 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.22 
 
 
402 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.81 
 
 
398 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  35.01 
 
 
401 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.04 
 
 
429 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.44 
 
 
400 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.73 
 
 
393 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.32 
 
 
406 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.29 
 
 
423 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.51 
 
 
410 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.75 
 
 
395 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.37 
 
 
414 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  35.89 
 
 
414 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>