More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  100 
 
 		 405 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  62.4 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  60.2 
 
 		 423 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  60.47 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  48.05 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  48.05 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  48.05 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  46.08 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  45.52 
 
 		 406 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  44.19 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  44.25 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  44.7 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  44.79 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  44.31 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  40.98 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.38 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  42 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  42.08 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  41.77 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.74 
 
 		 408 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  41.73 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  41.49 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  40.1 
 
 		 408 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  41.41 
 
 		 402 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.56 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.25 
 
 		 436 aa  252  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  40.82 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  40.36 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  37.72 
 
 		 414 aa  249  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  41.21 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  36.88 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.06 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.75 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.75 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.36 
 
 		 407 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  35.14 
 
 		 409 aa  242  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  39.32 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.5 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.56 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.54 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.63 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  34.86 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.18 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.4 
 
 		 408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  37.01 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.65 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  37.63 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  38.5 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.52 
 
 		 400 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.32 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.48 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  38.27 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.55 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.76 
 
 		 409 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.81 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.21 
 
 		 412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  35.05 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  33.6 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  33.6 
 
 		 412 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  35.92 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  33.33 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  38.49 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.53 
 
 		 412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  36.7 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  36.7 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  36.7 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  38.52 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.03 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.29 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  40.77 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  39.41 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.11 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.08 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.74 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  36.08 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.51 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.51 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.55 
 
 		 405 aa  209  8e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  35.84 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.72 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.92 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35.88 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.06 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  39.06 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.99 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.29 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  36.03 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  33.59 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.51 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  36.25 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.02 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  36.9 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  35.16 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.5 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.96 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.6 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  36.68 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.07 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>