More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2535 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  100 
 
 
423 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  60.2 
 
 
405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  55.93 
 
 
395 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  51.55 
 
 
388 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  44.76 
 
 
406 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  44.76 
 
 
406 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  44.76 
 
 
406 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  292  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  42.97 
 
 
399 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  45.38 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  44.99 
 
 
399 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.16 
 
 
406 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  43.11 
 
 
399 aa  279  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.13 
 
 
400 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  37.94 
 
 
401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.25 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  41.89 
 
 
399 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  40.48 
 
 
421 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.49 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.31 
 
 
401 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  42.15 
 
 
423 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  42.13 
 
 
394 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.21 
 
 
400 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.33 
 
 
436 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  39.68 
 
 
407 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  38.52 
 
 
414 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  38.18 
 
 
405 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.66 
 
 
415 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  36.82 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40.39 
 
 
410 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.31 
 
 
400 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  37.62 
 
 
409 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.38 
 
 
345 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.49 
 
 
402 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.95 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.95 
 
 
400 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  35.92 
 
 
404 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  36.72 
 
 
401 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  39.75 
 
 
400 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  38.46 
 
 
421 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  38.46 
 
 
421 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  38.46 
 
 
421 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.53 
 
 
402 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.84 
 
 
400 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  33.08 
 
 
409 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  38.75 
 
 
357 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  36.2 
 
 
403 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.46 
 
 
407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.46 
 
 
407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.18 
 
 
398 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  36.05 
 
 
408 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  31.96 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  34.55 
 
 
416 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.44 
 
 
417 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.2 
 
 
395 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  35.66 
 
 
408 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.99 
 
 
391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  34.65 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.17 
 
 
409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  36.51 
 
 
397 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.51 
 
 
402 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  31.77 
 
 
412 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  31.77 
 
 
412 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.07 
 
 
395 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.51 
 
 
407 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.8 
 
 
398 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  31.51 
 
 
412 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.91 
 
 
411 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.24 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.09 
 
 
394 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  38.73 
 
 
397 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.14 
 
 
393 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  35.62 
 
 
413 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  38.05 
 
 
405 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.09 
 
 
412 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  37.54 
 
 
395 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.69 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.44 
 
 
408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.6 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  33.76 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  36.62 
 
 
375 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  38.38 
 
 
404 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.69 
 
 
398 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  33.94 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.77 
 
 
400 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.36 
 
 
411 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  34.51 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  32.52 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.62 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  34.32 
 
 
424 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.05 
 
 
399 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  32.31 
 
 
402 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  34.9 
 
 
406 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  32.39 
 
 
402 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.89 
 
 
410 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.05 
 
 
411 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  32.05 
 
 
403 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.05 
 
 
411 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.37 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.59 
 
 
411 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>