More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2103 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  100 
 
 
415 aa  833    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  53.45 
 
 
407 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  47.16 
 
 
398 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  44.04 
 
 
405 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  42.92 
 
 
409 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  42.89 
 
 
404 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  43.48 
 
 
408 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  41.19 
 
 
403 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  41.48 
 
 
399 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  42.61 
 
 
395 aa  285  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  39.23 
 
 
408 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  39.42 
 
 
401 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  42.11 
 
 
436 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.63 
 
 
401 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  42.14 
 
 
407 aa  277  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  41.5 
 
 
409 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  41.5 
 
 
407 aa  272  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  39.85 
 
 
401 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  38.86 
 
 
416 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  41.02 
 
 
409 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  39.22 
 
 
407 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  39.47 
 
 
424 aa  266  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40.51 
 
 
400 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.71 
 
 
400 aa  265  8.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  41.47 
 
 
430 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.05 
 
 
399 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.77 
 
 
406 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  41.28 
 
 
409 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  38.72 
 
 
409 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.53 
 
 
408 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  42.89 
 
 
400 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  39.11 
 
 
400 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.75 
 
 
404 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.14 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.14 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  38.13 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.94 
 
 
399 aa  253  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40.68 
 
 
410 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.92 
 
 
421 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  39.76 
 
 
421 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  39.76 
 
 
421 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  39.76 
 
 
421 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.81 
 
 
345 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  37.37 
 
 
400 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  38.73 
 
 
412 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  38.73 
 
 
412 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.42 
 
 
398 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  37.16 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  38.5 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  38.08 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.72 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.72 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.72 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  36.43 
 
 
401 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.8 
 
 
423 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  39.15 
 
 
400 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.18 
 
 
405 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.82 
 
 
399 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  39.55 
 
 
406 aa  237  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  37.95 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  38.82 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.86 
 
 
402 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.26 
 
 
394 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.92 
 
 
391 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  42.64 
 
 
357 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  37.13 
 
 
411 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  37.4 
 
 
388 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  36.53 
 
 
405 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.95 
 
 
394 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.91 
 
 
397 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  37.66 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  37.91 
 
 
406 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.6 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  33.25 
 
 
415 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.67 
 
 
408 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.84 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  38.74 
 
 
395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  35.28 
 
 
413 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.77 
 
 
375 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  37.53 
 
 
395 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.24 
 
 
393 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  34.13 
 
 
399 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.26 
 
 
395 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.14 
 
 
417 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.73 
 
 
405 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  36.1 
 
 
411 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.99 
 
 
412 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.16 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  36.61 
 
 
397 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.72 
 
 
410 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.78 
 
 
419 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  34.38 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.99 
 
 
412 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.52 
 
 
411 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.26 
 
 
420 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.35 
 
 
404 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.9 
 
 
406 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  37.74 
 
 
409 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  34.64 
 
 
406 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.28 
 
 
402 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>