More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3692 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  100 
 
 		 397 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  40.05 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  40.19 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  37.69 
 
 		 409 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  39.49 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.36 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  37.44 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  39 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.84 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.5 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.43 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.2 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  38.92 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.53 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  38.44 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  38.11 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  36.91 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  40.25 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.18 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  36.86 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  36.86 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.75 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.75 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  38.77 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  36.59 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  35.82 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  35.82 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  35.82 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.87 
 
 		 409 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  37.97 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.19 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.67 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40.05 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  37.47 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  38.24 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  36.83 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  35.86 
 
 		 414 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  38.73 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  36.07 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.27 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  41.21 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  35.53 
 
 		 405 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  34.96 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.15 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  36.17 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  35 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.23 
 
 		 394 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  35.98 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.02 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  35.55 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  36.92 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.59 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  36.44 
 
 		 375 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  36.61 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  36.04 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  34.24 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  39.67 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  38.08 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  32.14 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  35.81 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  38.38 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  35.62 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  38.7 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.55 
 
 		 423 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  35.07 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.95 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  33.93 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  36.71 
 
 		 400 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  33.99 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  35.04 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  35.55 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.66 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.17 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  33.51 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.86 
 
 		 402 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  34.65 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  33.93 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  36.9 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  36.19 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.01 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  32.67 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.6 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.93 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.07 
 
 		 418 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  32.41 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  36.59 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  35.86 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  34.51 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  35.04 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.36 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.88 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.49 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.6 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  35.97 
 
 		 412 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  31.54 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.98 
 
 		 423 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33.59 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>