More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2024 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  100 
 
 
424 aa  848    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  45.48 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  44.11 
 
 
408 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  46.35 
 
 
400 aa  325  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  43.32 
 
 
416 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  41.78 
 
 
409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  44.5 
 
 
398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  42.96 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  41.75 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.71 
 
 
409 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  44 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  40.77 
 
 
400 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  41.65 
 
 
407 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  40 
 
 
405 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  42.96 
 
 
430 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  40.2 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  41.65 
 
 
404 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  39.6 
 
 
401 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.53 
 
 
406 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  38.93 
 
 
415 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.46 
 
 
400 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  39.95 
 
 
415 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  40.25 
 
 
395 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  39.13 
 
 
408 aa  272  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  39.65 
 
 
399 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  41.15 
 
 
400 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  41.54 
 
 
406 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  41.54 
 
 
406 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  41.54 
 
 
406 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  36.41 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  38.76 
 
 
421 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  38.76 
 
 
421 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  38.76 
 
 
421 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.71 
 
 
421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  44.08 
 
 
406 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  36.16 
 
 
409 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  42.2 
 
 
410 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.49 
 
 
401 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.66 
 
 
399 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  38 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.14 
 
 
407 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.14 
 
 
407 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  41.12 
 
 
399 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  39.6 
 
 
406 aa  259  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.74 
 
 
399 aa  259  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.13 
 
 
408 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  43.15 
 
 
412 aa  259  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  39.71 
 
 
407 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  41.73 
 
 
400 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  40.1 
 
 
405 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  39.45 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  39.31 
 
 
400 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.62 
 
 
402 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  38.06 
 
 
410 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  40.1 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  42.77 
 
 
357 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  40.54 
 
 
436 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  35.54 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  35.54 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  35.54 
 
 
412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  36.72 
 
 
397 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.05 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  38.4 
 
 
375 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.39 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  37.53 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  42.26 
 
 
345 aa  232  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.34 
 
 
405 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.93 
 
 
408 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  34.77 
 
 
400 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.02 
 
 
400 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  32.92 
 
 
401 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  36.72 
 
 
388 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.77 
 
 
394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38 
 
 
426 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.72 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  36.91 
 
 
413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.71 
 
 
394 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.95 
 
 
400 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.15 
 
 
391 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  33.59 
 
 
405 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.99 
 
 
417 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.89 
 
 
406 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.9 
 
 
423 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  37.41 
 
 
405 aa  206  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.83 
 
 
414 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.49 
 
 
395 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.11 
 
 
405 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.36 
 
 
402 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.82 
 
 
411 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.89 
 
 
420 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.13 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.36 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.19 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35.07 
 
 
397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.81 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.62 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.07 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  36.19 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  37.81 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.93 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>