More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2538 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  77.89 
 
 
416 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  49.27 
 
 
403 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  47.12 
 
 
409 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  47.25 
 
 
408 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  47.62 
 
 
405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  44.2 
 
 
407 aa  345  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  43.83 
 
 
409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  46.58 
 
 
400 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  43.58 
 
 
409 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  48.35 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  46.35 
 
 
398 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  44.11 
 
 
424 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  44.11 
 
 
401 aa  322  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  42.62 
 
 
407 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  42.78 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  42.78 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  42.78 
 
 
412 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  42.2 
 
 
404 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  43.38 
 
 
399 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  41.81 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  41.81 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  41.81 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  45.06 
 
 
395 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  42.82 
 
 
408 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  44.47 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  44.47 
 
 
407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  43.18 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  39.41 
 
 
409 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  42.86 
 
 
404 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  41.18 
 
 
411 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  43.7 
 
 
404 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  40.2 
 
 
400 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  40.66 
 
 
421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  39.23 
 
 
415 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  42.6 
 
 
399 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  42.64 
 
 
408 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.94 
 
 
399 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  42.15 
 
 
406 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  42.15 
 
 
406 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  42.15 
 
 
406 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  41.46 
 
 
401 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  42.15 
 
 
414 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40.6 
 
 
410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40.98 
 
 
400 aa  268  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  38.52 
 
 
415 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  37.37 
 
 
406 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.62 
 
 
406 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  39 
 
 
405 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  38.05 
 
 
407 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.76 
 
 
399 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.28 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  38.96 
 
 
410 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  37.53 
 
 
407 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40.53 
 
 
406 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.15 
 
 
400 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.71 
 
 
398 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  44.27 
 
 
357 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.78 
 
 
436 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  40.4 
 
 
345 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.37 
 
 
394 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  37.03 
 
 
397 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  36.52 
 
 
401 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  39.49 
 
 
397 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  37.19 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  36.07 
 
 
400 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.4 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.91 
 
 
409 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.33 
 
 
375 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.52 
 
 
391 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.37 
 
 
410 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.25 
 
 
394 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.7 
 
 
405 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  38.6 
 
 
388 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.86 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.32 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.16 
 
 
411 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.4 
 
 
412 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  37.53 
 
 
405 aa  219  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.07 
 
 
423 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.7 
 
 
412 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.91 
 
 
402 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.99 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  32.36 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  34.83 
 
 
401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  35.84 
 
 
398 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  32.55 
 
 
419 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  36.01 
 
 
406 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.93 
 
 
426 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  37.09 
 
 
403 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.06 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.56 
 
 
411 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.09 
 
 
395 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.39 
 
 
411 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.99 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.99 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.28 
 
 
423 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.99 
 
 
411 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.74 
 
 
411 aa  203  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>