More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7070 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  824    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  79.95 
 
 
409 aa  668    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  68.87 
 
 
407 aa  578  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  63 
 
 
407 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  60.9 
 
 
405 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  54.27 
 
 
409 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  54.66 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  53.16 
 
 
412 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  53.16 
 
 
412 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  52.91 
 
 
412 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  49.39 
 
 
421 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  49.39 
 
 
421 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  49.39 
 
 
421 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  53.11 
 
 
400 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  50.87 
 
 
403 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  47.25 
 
 
408 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  49.25 
 
 
416 aa  358  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  47.87 
 
 
398 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  46.78 
 
 
399 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  48.3 
 
 
395 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  47.18 
 
 
401 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  48 
 
 
407 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  46.12 
 
 
404 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  48 
 
 
407 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  47 
 
 
404 aa  338  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  48.33 
 
 
410 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  46.13 
 
 
406 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  46.12 
 
 
401 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  46.65 
 
 
400 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  46.12 
 
 
405 aa  322  6e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  43.22 
 
 
409 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  45.11 
 
 
408 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  45.86 
 
 
410 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.75 
 
 
424 aa  308  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  44.89 
 
 
400 aa  308  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  44.86 
 
 
430 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  42.54 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  45.61 
 
 
408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  42.51 
 
 
400 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  43.03 
 
 
400 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  45.48 
 
 
399 aa  298  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  45.18 
 
 
400 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  42.89 
 
 
411 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  43.48 
 
 
415 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  44.17 
 
 
414 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  41.54 
 
 
399 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  44.13 
 
 
402 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  42.51 
 
 
400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  39.79 
 
 
415 aa  285  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  42.71 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  43.56 
 
 
375 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.4 
 
 
436 aa  280  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  43.04 
 
 
406 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  41.22 
 
 
421 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  40.4 
 
 
404 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  42.64 
 
 
406 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  42.64 
 
 
406 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  42.64 
 
 
406 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  40.34 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.36 
 
 
406 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  43.45 
 
 
357 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.4 
 
 
394 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.9 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  41.56 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.84 
 
 
398 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  46.18 
 
 
345 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  38.12 
 
 
401 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.51 
 
 
402 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  39.38 
 
 
397 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.9 
 
 
394 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.56 
 
 
412 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.74 
 
 
408 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.69 
 
 
391 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.71 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  40.48 
 
 
423 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  42.49 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  40.56 
 
 
399 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  37.29 
 
 
401 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  39.32 
 
 
405 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  40.05 
 
 
393 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  41.03 
 
 
405 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.9 
 
 
400 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.13 
 
 
412 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.23 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.53 
 
 
419 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.44 
 
 
411 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.69 
 
 
402 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  38.94 
 
 
401 aa  225  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.21 
 
 
411 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.19 
 
 
395 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.16 
 
 
406 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.11 
 
 
417 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.51 
 
 
400 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.23 
 
 
398 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  36.13 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.97 
 
 
397 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  41.67 
 
 
418 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  35.13 
 
 
425 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37 
 
 
404 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.22 
 
 
426 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>