More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2524 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  43.61 
 
 
399 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  41.85 
 
 
401 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  42.96 
 
 
404 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.45 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  42.49 
 
 
395 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  42.64 
 
 
408 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  40.1 
 
 
408 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  40.59 
 
 
399 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  41.46 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  41.48 
 
 
399 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  41.03 
 
 
408 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40.72 
 
 
406 aa  269  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40.44 
 
 
406 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40.44 
 
 
406 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40.44 
 
 
406 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  39.61 
 
 
409 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  40.91 
 
 
400 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  40.77 
 
 
405 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  39.71 
 
 
416 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.66 
 
 
406 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  40.05 
 
 
407 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  37.68 
 
 
400 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  40.45 
 
 
405 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40.66 
 
 
410 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  37.97 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  39.69 
 
 
399 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  40.25 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  38.02 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  39.95 
 
 
407 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  40.25 
 
 
400 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  38.13 
 
 
405 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  39.7 
 
 
436 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.12 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  36.84 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.3 
 
 
402 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.53 
 
 
388 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.64 
 
 
345 aa  242  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  42.99 
 
 
357 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  38.02 
 
 
400 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  35.24 
 
 
409 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.12 
 
 
400 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  37.41 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  38.82 
 
 
400 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  37.65 
 
 
407 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  32.6 
 
 
409 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  38.05 
 
 
423 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  33.25 
 
 
409 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  41.94 
 
 
394 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.92 
 
 
411 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.58 
 
 
375 aa  229  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.21 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.21 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  38.54 
 
 
409 aa  226  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.92 
 
 
412 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  38.12 
 
 
398 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  32.98 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  32.98 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.36 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  36.14 
 
 
410 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  40.31 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  32.98 
 
 
412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.59 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  36.25 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.65 
 
 
398 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  34.71 
 
 
423 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.69 
 
 
395 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  34.24 
 
 
421 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  34.24 
 
 
421 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  34.24 
 
 
421 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  35.28 
 
 
397 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  33.58 
 
 
401 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.32 
 
 
405 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35.06 
 
 
397 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  33.93 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  37.4 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.29 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  31.98 
 
 
406 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  34.02 
 
 
415 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.7 
 
 
426 aa  193  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.17 
 
 
411 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.01 
 
 
388 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  31.85 
 
 
415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  30.99 
 
 
400 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.99 
 
 
412 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  35.04 
 
 
401 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.54 
 
 
402 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  34.81 
 
 
406 aa  186  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.99 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.23 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.49 
 
 
399 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  31.03 
 
 
407 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  31.85 
 
 
395 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  36.07 
 
 
404 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  34.63 
 
 
400 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.11 
 
 
411 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.37 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  32.18 
 
 
399 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.34 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  33.51 
 
 
393 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>