More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3361 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  100 
 
 
425 aa  852    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  43.52 
 
 
404 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  39.8 
 
 
404 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  39.39 
 
 
403 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  40.49 
 
 
406 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  39.56 
 
 
403 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.9 
 
 
398 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.71 
 
 
394 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  41.77 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.48 
 
 
395 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.04 
 
 
399 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.58 
 
 
395 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  35.47 
 
 
409 aa  223  7e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.43 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  35.13 
 
 
408 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.27 
 
 
398 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  35.86 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.92 
 
 
420 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  32.84 
 
 
409 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  35.11 
 
 
400 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  37.83 
 
 
411 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.97 
 
 
412 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.47 
 
 
401 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.25 
 
 
423 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  34.96 
 
 
404 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.2 
 
 
426 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  34.31 
 
 
406 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.44 
 
 
399 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.64 
 
 
412 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  39.02 
 
 
401 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.77 
 
 
411 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.74 
 
 
436 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.66 
 
 
391 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.95 
 
 
411 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.55 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  36.67 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  36.13 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  35.26 
 
 
409 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  35.24 
 
 
402 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  31.8 
 
 
409 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  34.57 
 
 
407 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.43 
 
 
411 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  32.84 
 
 
405 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.76 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.65 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  37.13 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  33.16 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  33.16 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  33.92 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.22 
 
 
402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.28 
 
 
405 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.35 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  32.89 
 
 
412 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.42 
 
 
408 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.08 
 
 
401 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  35.18 
 
 
403 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.31 
 
 
400 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  30.83 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.63 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.19 
 
 
406 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  30.83 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  35.07 
 
 
399 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.35 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  37.16 
 
 
397 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.83 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.63 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  33.42 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  36.1 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  32.45 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.39 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  31.59 
 
 
420 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  35.77 
 
 
388 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  35.46 
 
 
423 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  34.75 
 
 
395 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  32.75 
 
 
415 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.66 
 
 
402 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.71 
 
 
399 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  34.26 
 
 
395 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  33.84 
 
 
400 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  31.5 
 
 
401 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  35.29 
 
 
430 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  31.69 
 
 
396 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  35.32 
 
 
398 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  33.42 
 
 
417 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.74 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  35.04 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  33.67 
 
 
407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  31.63 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.09 
 
 
398 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  32.66 
 
 
421 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  32.35 
 
 
415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  32.51 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  34.59 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.24 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.58 
 
 
400 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.42 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  33.51 
 
 
397 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  35.48 
 
 
410 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>