More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2740 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  100 
 
 
400 aa  803    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  67.67 
 
 
401 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  59.69 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  59.49 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  58.69 
 
 
436 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  56.75 
 
 
407 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  56.39 
 
 
399 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  57.37 
 
 
395 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  54.29 
 
 
401 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  54.43 
 
 
408 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  54.18 
 
 
400 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  53.92 
 
 
400 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  53.71 
 
 
410 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  51.65 
 
 
408 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  50.5 
 
 
400 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  51.98 
 
 
430 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  49.87 
 
 
397 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  47.31 
 
 
421 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  48.39 
 
 
402 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  50.14 
 
 
357 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  47.83 
 
 
414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  45.22 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  45.22 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  46.37 
 
 
409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  44.89 
 
 
399 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  48.97 
 
 
345 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  42.82 
 
 
403 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  43.03 
 
 
408 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  44.39 
 
 
399 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.3 
 
 
409 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  43.58 
 
 
405 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  42.36 
 
 
401 aa  292  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  42.17 
 
 
400 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  45.6 
 
 
406 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  45.6 
 
 
406 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  46.1 
 
 
394 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  45.6 
 
 
406 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  43.85 
 
 
406 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  40.91 
 
 
407 aa  279  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  42.21 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.34 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  39.35 
 
 
409 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  44.27 
 
 
406 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  40.98 
 
 
408 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.78 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  40.97 
 
 
416 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  40.51 
 
 
415 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.15 
 
 
424 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.94 
 
 
404 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  38.56 
 
 
409 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  44.33 
 
 
400 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  40.1 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  40.05 
 
 
421 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  40.05 
 
 
421 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  40.05 
 
 
421 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.86 
 
 
423 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  39.69 
 
 
415 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.27 
 
 
395 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.47 
 
 
398 aa  256  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.39 
 
 
391 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  43.73 
 
 
397 aa  249  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  38.2 
 
 
412 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  38.2 
 
 
412 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  40.7 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  38.44 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.54 
 
 
408 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.44 
 
 
417 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  37.93 
 
 
412 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.58 
 
 
405 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.45 
 
 
412 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  39.11 
 
 
410 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  38.21 
 
 
413 aa  239  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.38 
 
 
395 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  38.4 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  38.44 
 
 
397 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  36.5 
 
 
411 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.34 
 
 
395 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.32 
 
 
407 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  36.55 
 
 
405 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  35.66 
 
 
404 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  36.25 
 
 
393 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.79 
 
 
406 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  37.28 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  35.75 
 
 
406 aa  216  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.4 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  35.9 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.7 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.24 
 
 
399 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.11 
 
 
400 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  36.95 
 
 
423 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  35.53 
 
 
403 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40 
 
 
400 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.71 
 
 
423 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.67 
 
 
402 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.46 
 
 
400 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.8 
 
 
419 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.19 
 
 
410 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  36.29 
 
 
406 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.58 
 
 
396 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>