More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3470 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  100 
 
 
404 aa  801    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  54.94 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  47 
 
 
408 aa  352  5e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  49.49 
 
 
403 aa  346  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  47.99 
 
 
407 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  47.49 
 
 
409 aa  336  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  45.75 
 
 
405 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  44.17 
 
 
401 aa  319  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  42.2 
 
 
408 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  44 
 
 
424 aa  317  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  42.89 
 
 
415 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  45.25 
 
 
409 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  43.43 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  43.89 
 
 
416 aa  299  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  45.86 
 
 
400 aa  298  9e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  43 
 
 
407 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  41.48 
 
 
407 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  41.5 
 
 
409 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  42.14 
 
 
409 aa  289  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  41.62 
 
 
411 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  41.87 
 
 
408 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  44.7 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  43.78 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  40.05 
 
 
401 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  43.35 
 
 
430 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  42.39 
 
 
407 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  42.39 
 
 
407 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  43.07 
 
 
400 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  42.97 
 
 
399 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  42.61 
 
 
408 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  43.6 
 
 
410 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  42.57 
 
 
421 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  42.57 
 
 
421 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  42.57 
 
 
421 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  40.65 
 
 
421 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  38.83 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  38.83 
 
 
412 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.67 
 
 
436 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  42.05 
 
 
401 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  38.59 
 
 
412 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  41.15 
 
 
404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  42.04 
 
 
404 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  40.8 
 
 
410 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.46 
 
 
405 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.91 
 
 
400 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40.7 
 
 
400 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  39.75 
 
 
415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  39.45 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  41.06 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  40.25 
 
 
400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  40.87 
 
 
409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  43.32 
 
 
406 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  41.96 
 
 
402 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  42.49 
 
 
394 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.6 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  46.52 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.69 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.69 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.69 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  39.29 
 
 
407 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  40.75 
 
 
400 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  40.05 
 
 
397 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.8 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.28 
 
 
398 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  38.12 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  40.3 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.65 
 
 
391 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.29 
 
 
412 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.43 
 
 
400 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  40 
 
 
405 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.28 
 
 
405 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.49 
 
 
406 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.66 
 
 
402 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.35 
 
 
399 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.16 
 
 
408 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.77 
 
 
345 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.11 
 
 
426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.95 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.76 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.65 
 
 
395 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.78 
 
 
411 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40.77 
 
 
400 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.1 
 
 
395 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.42 
 
 
398 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  38.28 
 
 
388 aa  210  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.76 
 
 
394 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.91 
 
 
398 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.23 
 
 
420 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.43 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.99 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  38.38 
 
 
423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  36.23 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  36.99 
 
 
406 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.48 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.34 
 
 
400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  35.87 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.37 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.35 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  33.82 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.1 
 
 
397 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>