More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3475 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  100 
 
 		 398 aa  791    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  54.94 
 
 		 404 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  47.87 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  49.13 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  47.75 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  47.87 
 
 		 407 aa  343  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  47.16 
 
 		 415 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  46.35 
 
 		 408 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  47.07 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  45.25 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  46.97 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  43.73 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  44.25 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  45.23 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  44.31 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  47.99 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  42.96 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  44.53 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  46.56 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  42.93 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  42.93 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  44.95 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  42.49 
 
 		 409 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  39.9 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  43.45 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  45.52 
 
 		 410 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  40.15 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  42.26 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  45.48 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  43.21 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  43.7 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  43.28 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  42.89 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  42.75 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  44.67 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  43.4 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  39.08 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  39.08 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  41.77 
 
 		 399 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  38.83 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  39.8 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  39.8 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  39.8 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  42.46 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.39 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.71 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  40.45 
 
 		 407 aa  270  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  42.56 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  42.78 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.41 
 
 		 421 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.75 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.71 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  46.25 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40.59 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  42.89 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  41.84 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  41.32 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  41.32 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  41.32 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.81 
 
 		 400 aa  256  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  39.43 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.75 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.05 
 
 		 408 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  41.13 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.66 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  40.29 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  44.73 
 
 		 345 aa  244  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.77 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.93 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  38.59 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.26 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  39.26 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.07 
 
 		 417 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.87 
 
 		 426 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  38.46 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.56 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.29 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.39 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  38.97 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.38 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.63 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.68 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.78 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.27 
 
 		 402 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33.42 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.74 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.31 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40.26 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  36.78 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  38.52 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.12 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.25 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.25 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.99 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.99 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.33 
 
 		 395 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.93 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.99 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  41.53 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.69 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>