More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  817    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  48.5 
 
 
400 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  46.13 
 
 
408 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  45.66 
 
 
409 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  44.64 
 
 
405 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  44.44 
 
 
407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.77 
 
 
404 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  39.76 
 
 
410 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  43.61 
 
 
395 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  41.56 
 
 
403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  38.63 
 
 
409 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  38.37 
 
 
409 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  40.88 
 
 
405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.75 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  39.95 
 
 
407 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  39.95 
 
 
407 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  40.69 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  37.97 
 
 
412 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  37.97 
 
 
412 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  37.97 
 
 
412 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.53 
 
 
400 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  41.04 
 
 
399 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.37 
 
 
408 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.67 
 
 
408 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  38.77 
 
 
415 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  41.19 
 
 
375 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  41.99 
 
 
400 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  38.86 
 
 
416 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.22 
 
 
398 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  41.2 
 
 
410 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.87 
 
 
401 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  39.6 
 
 
424 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  37.56 
 
 
409 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  39.8 
 
 
430 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.13 
 
 
401 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.27 
 
 
408 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  34.66 
 
 
421 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  34.66 
 
 
421 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  34.66 
 
 
421 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.87 
 
 
398 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  40.56 
 
 
409 aa  242  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.59 
 
 
421 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.38 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.9 
 
 
406 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  39.45 
 
 
404 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.9 
 
 
406 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.9 
 
 
406 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.12 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.21 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  38 
 
 
404 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  39.14 
 
 
414 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  36.5 
 
 
399 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.5 
 
 
406 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  38.44 
 
 
397 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  38.89 
 
 
436 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  41.85 
 
 
357 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.25 
 
 
407 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.11 
 
 
400 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.19 
 
 
394 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.83 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.49 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.14 
 
 
412 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  34.68 
 
 
415 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.05 
 
 
400 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  36.43 
 
 
405 aa  216  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.75 
 
 
400 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40.91 
 
 
400 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.59 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.53 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.63 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  33.66 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.47 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.09 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  37.97 
 
 
406 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.61 
 
 
408 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  35.22 
 
 
400 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  33.59 
 
 
399 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  34.31 
 
 
425 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.31 
 
 
401 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.16 
 
 
412 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  38.63 
 
 
397 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  36.9 
 
 
405 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.26 
 
 
411 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.02 
 
 
388 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  36.76 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.25 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.96 
 
 
410 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  34.24 
 
 
397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.36 
 
 
400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  34.36 
 
 
399 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  30.6 
 
 
400 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.88 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.83 
 
 
404 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.83 
 
 
402 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  38.82 
 
 
395 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.05 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>