More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4689 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  100 
 
 
402 aa  791    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  52.23 
 
 
399 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  53.23 
 
 
395 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  51.4 
 
 
400 aa  363  4e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  47.37 
 
 
401 aa  358  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  51.76 
 
 
401 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  48.88 
 
 
400 aa  348  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  47.51 
 
 
408 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  47.04 
 
 
408 aa  338  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  48.99 
 
 
399 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  49.75 
 
 
410 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  47.99 
 
 
436 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  48.07 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  44.15 
 
 
407 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  44.95 
 
 
397 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  49.86 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  45.68 
 
 
409 aa  299  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  45.83 
 
 
409 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  45.61 
 
 
430 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  45.59 
 
 
404 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  44.13 
 
 
408 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  44.77 
 
 
400 aa  292  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  44.3 
 
 
400 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  43.64 
 
 
405 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  46.77 
 
 
414 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  45.45 
 
 
345 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  42.41 
 
 
400 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  43.33 
 
 
407 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  42.75 
 
 
399 aa  273  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  41.09 
 
 
401 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  39.76 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  45.57 
 
 
398 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  40.1 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.71 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  39.69 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  38.9 
 
 
409 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  41.25 
 
 
405 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  41.73 
 
 
407 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  41.73 
 
 
407 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  40.34 
 
 
416 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  42.93 
 
 
406 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  42.93 
 
 
406 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  42.93 
 
 
406 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  41.16 
 
 
403 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.39 
 
 
398 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  39.8 
 
 
400 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  39.5 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  41.19 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  42.21 
 
 
400 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  38.58 
 
 
412 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  38.58 
 
 
412 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  42.57 
 
 
394 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  38.32 
 
 
412 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.46 
 
 
391 aa  248  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.36 
 
 
405 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  38.05 
 
 
411 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.9 
 
 
388 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  41.88 
 
 
395 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.39 
 
 
424 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  41.69 
 
 
400 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  38.76 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  38.76 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  38.76 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  42.3 
 
 
404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.14 
 
 
406 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.77 
 
 
406 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.66 
 
 
404 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  38.57 
 
 
415 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.06 
 
 
405 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.15 
 
 
394 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.54 
 
 
402 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  37.62 
 
 
413 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  37.03 
 
 
393 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  39.85 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  37.31 
 
 
403 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  38.93 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.1 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.72 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  37.11 
 
 
415 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.75 
 
 
398 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.97 
 
 
410 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.56 
 
 
411 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  37.91 
 
 
423 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.15 
 
 
397 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  38.36 
 
 
406 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.74 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  37.32 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.12 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.95 
 
 
411 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.37 
 
 
419 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.38 
 
 
395 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.69 
 
 
397 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.73 
 
 
410 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.57 
 
 
375 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  37.47 
 
 
425 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.01 
 
 
395 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.2 
 
 
420 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.4 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.74 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.49 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>