More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3490 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  69.58 
 
 
403 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  70.15 
 
 
403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  67.73 
 
 
404 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  66.58 
 
 
401 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.82 
 
 
394 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  41.09 
 
 
399 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.94 
 
 
398 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  40.49 
 
 
425 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  40.66 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  41.92 
 
 
391 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.74 
 
 
411 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  39.26 
 
 
402 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.19 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.85 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.14 
 
 
395 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.31 
 
 
395 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.06 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.8 
 
 
412 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.05 
 
 
412 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.98 
 
 
409 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.86 
 
 
405 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.92 
 
 
404 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.83 
 
 
426 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.03 
 
 
407 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.5 
 
 
388 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.03 
 
 
407 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  36.06 
 
 
409 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.32 
 
 
402 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  43.4 
 
 
410 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  38.42 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  36.32 
 
 
395 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  37.4 
 
 
399 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.53 
 
 
405 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  35.79 
 
 
393 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  36.46 
 
 
409 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  38.36 
 
 
402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  38.11 
 
 
430 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.13 
 
 
398 aa  215  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  40.4 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  37.53 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  37.6 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  34.19 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  34.45 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  34.45 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.93 
 
 
411 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.19 
 
 
411 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.16 
 
 
411 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  36.01 
 
 
408 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  35.98 
 
 
404 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.62 
 
 
411 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  37.77 
 
 
450 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.43 
 
 
407 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  38.58 
 
 
409 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  35.96 
 
 
407 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.68 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.58 
 
 
420 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.34 
 
 
411 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.05 
 
 
419 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.68 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.4 
 
 
399 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  34.18 
 
 
408 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.2 
 
 
408 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  36.25 
 
 
421 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.71 
 
 
399 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.17 
 
 
423 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.29 
 
 
400 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  35.35 
 
 
410 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  37.16 
 
 
411 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.09 
 
 
400 aa  203  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.92 
 
 
411 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.43 
 
 
398 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  40.58 
 
 
357 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  33.59 
 
 
415 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  35.22 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  34.58 
 
 
406 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.49 
 
 
401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.78 
 
 
418 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40.13 
 
 
402 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.7 
 
 
399 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  37.18 
 
 
406 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.18 
 
 
406 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  37.18 
 
 
406 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  36.71 
 
 
400 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  34.46 
 
 
412 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  34.46 
 
 
412 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.98 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.18 
 
 
436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.82 
 
 
412 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  34.88 
 
 
401 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  35.04 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  36.36 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.25 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.63 
 
 
405 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  34.68 
 
 
407 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.44 
 
 
380 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  34.2 
 
 
412 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>