More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2693 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  100 
 
 
395 aa  807    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  72.91 
 
 
395 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  47.86 
 
 
394 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  45.64 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  42.07 
 
 
398 aa  279  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.78 
 
 
412 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.48 
 
 
405 aa  263  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  38.57 
 
 
404 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.73 
 
 
408 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.06 
 
 
402 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  37.53 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.96 
 
 
423 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.42 
 
 
411 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.26 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.22 
 
 
391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  36.48 
 
 
425 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  37.21 
 
 
421 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.71 
 
 
401 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.92 
 
 
412 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.95 
 
 
406 aa  240  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.86 
 
 
426 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  37.11 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.98 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  36.27 
 
 
408 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  36.14 
 
 
406 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.31 
 
 
411 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.38 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.27 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.62 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  36.27 
 
 
403 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.73 
 
 
399 aa  232  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.44 
 
 
394 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  37.53 
 
 
400 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.2 
 
 
401 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.39 
 
 
406 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.39 
 
 
406 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.34 
 
 
400 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.39 
 
 
406 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  37.72 
 
 
401 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  36.07 
 
 
399 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  37.65 
 
 
395 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.49 
 
 
410 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  37.68 
 
 
407 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  36.32 
 
 
405 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.11 
 
 
406 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  33.5 
 
 
402 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.76 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  36.99 
 
 
404 aa  226  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  36.05 
 
 
411 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  37.38 
 
 
409 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.08 
 
 
420 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  31.63 
 
 
393 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.46 
 
 
417 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  35.86 
 
 
400 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.59 
 
 
400 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.5 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  35.09 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  37 
 
 
406 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  34.33 
 
 
398 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  35.6 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.07 
 
 
407 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.07 
 
 
407 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  35.82 
 
 
450 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.38 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  33.99 
 
 
403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.64 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  36.87 
 
 
404 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.64 
 
 
411 aa  216  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.69 
 
 
410 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.41 
 
 
398 aa  215  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.64 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.64 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.64 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.7 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  32.36 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  35.66 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.55 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.38 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.14 
 
 
399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.08 
 
 
400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.81 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.81 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.27 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.43 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.55 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.55 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  34.91 
 
 
407 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.85 
 
 
411 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.67 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  34.01 
 
 
409 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  33.83 
 
 
409 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.04 
 
 
410 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.2 
 
 
417 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.11 
 
 
436 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  35.07 
 
 
410 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.49 
 
 
407 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.58 
 
 
399 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  34.88 
 
 
388 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  33.25 
 
 
416 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.21 
 
 
388 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>