More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1037 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  815    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  44.25 
 
 
403 aa  335  7e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  43.22 
 
 
408 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.61 
 
 
409 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  43.01 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  41.09 
 
 
405 aa  306  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  42.93 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  41.9 
 
 
416 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  39.41 
 
 
408 aa  299  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.71 
 
 
424 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.49 
 
 
398 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  44.04 
 
 
405 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  44.42 
 
 
404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  41.58 
 
 
407 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  41.58 
 
 
407 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  41.98 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  42.07 
 
 
415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  41.29 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  41.31 
 
 
407 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  42.68 
 
 
399 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  41.46 
 
 
409 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  41.1 
 
 
409 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  40.25 
 
 
410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  40.29 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.52 
 
 
400 aa  272  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  39.13 
 
 
411 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  40.91 
 
 
400 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.29 
 
 
404 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  39.21 
 
 
430 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  41.29 
 
 
401 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.75 
 
 
401 aa  266  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  38.83 
 
 
397 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  38.95 
 
 
421 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  40.79 
 
 
399 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40.1 
 
 
400 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  41.2 
 
 
436 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  38.72 
 
 
415 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  40.54 
 
 
410 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.35 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  37.11 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  40.51 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.39 
 
 
402 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  38.52 
 
 
421 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  38.52 
 
 
421 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  38.52 
 
 
421 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  37.56 
 
 
406 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.85 
 
 
407 aa  249  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  43.13 
 
 
345 aa  249  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.91 
 
 
401 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  39.66 
 
 
409 aa  245  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  39.15 
 
 
412 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  39.15 
 
 
412 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  39.15 
 
 
412 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.82 
 
 
395 aa  236  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.86 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  38.52 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.04 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.05 
 
 
406 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.34 
 
 
400 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  35.81 
 
 
400 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.25 
 
 
398 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  36.73 
 
 
414 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.14 
 
 
412 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  35.28 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  35.28 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  35.28 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.41 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.34 
 
 
398 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.36 
 
 
399 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.9 
 
 
375 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.48 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  36.5 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.67 
 
 
408 aa  219  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.27 
 
 
394 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.71 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.66 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.34 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.84 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.58 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.01 
 
 
395 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.98 
 
 
394 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  35.15 
 
 
405 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  33.83 
 
 
401 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.24 
 
 
402 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.09 
 
 
411 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  33.92 
 
 
391 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.19 
 
 
418 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.67 
 
 
398 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  35.26 
 
 
425 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.12 
 
 
419 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.75 
 
 
420 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35.24 
 
 
399 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  38.36 
 
 
395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  33.25 
 
 
404 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  32.51 
 
 
413 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.57 
 
 
412 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.71 
 
 
411 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.04 
 
 
411 aa  193  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  33.95 
 
 
405 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>