More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1245 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  100 
 
 
397 aa  806    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  48.74 
 
 
400 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  49.87 
 
 
401 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  49.87 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  46.37 
 
 
399 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  46.95 
 
 
399 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  45.94 
 
 
408 aa  332  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  44.94 
 
 
408 aa  329  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  44.95 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  46.13 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  46.72 
 
 
400 aa  325  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  44.39 
 
 
401 aa  325  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  46.23 
 
 
410 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  46.08 
 
 
436 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  44.23 
 
 
421 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  43.43 
 
 
409 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  43.94 
 
 
402 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  41.78 
 
 
400 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  42.09 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  41.69 
 
 
400 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  42.12 
 
 
413 aa  275  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.12 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.19 
 
 
401 aa  272  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  38.83 
 
 
409 aa  272  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.61 
 
 
430 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  40.65 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  45.37 
 
 
357 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  39.9 
 
 
414 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  39.38 
 
 
408 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  43.91 
 
 
345 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  38.57 
 
 
405 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.3 
 
 
399 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.29 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.6 
 
 
407 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.6 
 
 
407 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  40.29 
 
 
398 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.69 
 
 
408 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  36.88 
 
 
407 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40 
 
 
406 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40 
 
 
406 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40 
 
 
406 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.32 
 
 
410 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  38.08 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  36.19 
 
 
416 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.44 
 
 
406 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  36.88 
 
 
403 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  36.11 
 
 
407 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.53 
 
 
406 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  36.72 
 
 
424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  36.57 
 
 
409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  35.66 
 
 
415 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.25 
 
 
405 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.22 
 
 
391 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.53 
 
 
398 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  39.9 
 
 
397 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  39.7 
 
 
404 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.42 
 
 
394 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.5 
 
 
394 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  35.92 
 
 
405 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  35.12 
 
 
412 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  35.12 
 
 
412 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  36.96 
 
 
406 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  35.32 
 
 
409 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  34.85 
 
 
412 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.19 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  38.17 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.25 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.69 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.6 
 
 
395 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  35.2 
 
 
415 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.11 
 
 
412 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.37 
 
 
408 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.61 
 
 
417 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  37.76 
 
 
423 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.21 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  38.35 
 
 
400 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.4 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  35.32 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.54 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.97 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.79 
 
 
398 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  35.2 
 
 
421 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  35.13 
 
 
402 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  35.2 
 
 
421 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  35.2 
 
 
421 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  33.75 
 
 
407 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  35.34 
 
 
375 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35.61 
 
 
399 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.84 
 
 
426 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.47 
 
 
397 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  34.73 
 
 
396 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.88 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  36.72 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  36.51 
 
 
423 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  32.91 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  33.99 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.92 
 
 
420 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.34 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  35.4 
 
 
401 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  34.76 
 
 
403 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>