More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3662 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  100 
 
 		 414 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  51.58 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  51.87 
 
 		 430 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  51.79 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  50.64 
 
 		 401 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  48.98 
 
 		 408 aa  344  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  48.48 
 
 		 401 aa  341  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  53.09 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  49.39 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  48.23 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  49.09 
 
 		 395 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  48.73 
 
 		 400 aa  326  6e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  47.83 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  48.74 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  47.58 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  46.67 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.69 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  44.99 
 
 		 407 aa  303  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  47.66 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  47.66 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  47.66 
 
 		 406 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  44.17 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  44.58 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  43.35 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  45.55 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  43.77 
 
 		 406 aa  289  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  45.74 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  43.18 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.55 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  42.15 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.46 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  41.19 
 
 		 407 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  42.32 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  40 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.25 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.95 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  40.09 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  40.09 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  41.19 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  39.11 
 
 		 409 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  43.4 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  45.02 
 
 		 345 aa  263  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  42.7 
 
 		 416 aa  259  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  40.2 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  40.98 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  39.9 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  40.1 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.34 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  39.45 
 
 		 424 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.72 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.76 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  38.74 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  38.74 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.35 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  38.74 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  41.06 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  39.51 
 
 		 404 aa  236  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  38.17 
 
 		 388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.95 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  37.06 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  39.14 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.1 
 
 		 423 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.49 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  38.52 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  37.19 
 
 		 421 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  37.19 
 
 		 421 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  37.19 
 
 		 421 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.48 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  36.73 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.46 
 
 		 391 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.31 
 
 		 417 aa  226  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.75 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  39.56 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.89 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.67 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  36.21 
 
 		 415 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.84 
 
 		 411 aa  216  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35.86 
 
 		 397 aa  215  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  36.99 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.05 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  37.31 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.01 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.38 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.73 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.4 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.84 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.81 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.3 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.31 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  34.94 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.04 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.87 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.34 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.78 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  34.89 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.19 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  36.36 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.77 
 
 		 401 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  36.63 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.47 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>