More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3241 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  100 
 
 
415 aa  842    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  39.79 
 
 
408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  42.07 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  40.81 
 
 
403 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  40.8 
 
 
405 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  40.66 
 
 
395 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  40.29 
 
 
409 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.93 
 
 
424 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.12 
 
 
400 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  38.73 
 
 
409 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  38.52 
 
 
408 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  40 
 
 
407 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.56 
 
 
405 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  38.57 
 
 
409 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  39.8 
 
 
407 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  37.66 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  41.71 
 
 
400 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  40.66 
 
 
399 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  38.42 
 
 
416 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  39.69 
 
 
400 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  39.23 
 
 
408 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.43 
 
 
398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  39.15 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  37.78 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  37.78 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  37.78 
 
 
421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  39.14 
 
 
430 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.62 
 
 
401 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  37.73 
 
 
412 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  37.73 
 
 
412 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  37.47 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  37.75 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  36.78 
 
 
401 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  37.9 
 
 
406 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.9 
 
 
406 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  37.9 
 
 
406 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  36.96 
 
 
400 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  38.4 
 
 
404 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  37.91 
 
 
400 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.31 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  39.24 
 
 
404 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  36.86 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  38.25 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  37.53 
 
 
421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  38.21 
 
 
399 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  36.18 
 
 
404 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.79 
 
 
407 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.79 
 
 
407 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  33.5 
 
 
401 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.29 
 
 
391 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.2 
 
 
436 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.07 
 
 
411 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  37.97 
 
 
406 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  36.36 
 
 
410 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.93 
 
 
399 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  34.68 
 
 
406 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  33.25 
 
 
415 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  36.21 
 
 
414 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.11 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  35.14 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  34.9 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.16 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.02 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.78 
 
 
397 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  37.62 
 
 
345 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  36.34 
 
 
400 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.66 
 
 
394 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  39.03 
 
 
357 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  35.07 
 
 
395 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  34.92 
 
 
400 aa  206  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35.98 
 
 
397 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  33.59 
 
 
406 aa  202  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.42 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.39 
 
 
423 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  35.86 
 
 
398 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  35.35 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.68 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.97 
 
 
412 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  33.59 
 
 
423 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.23 
 
 
404 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.59 
 
 
420 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  36.02 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  35.19 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  33.42 
 
 
388 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  34.69 
 
 
413 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  34.5 
 
 
405 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.43 
 
 
403 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.66 
 
 
410 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  32.75 
 
 
425 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.63 
 
 
417 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.79 
 
 
408 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  32.31 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.82 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  35 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  34.51 
 
 
403 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.33 
 
 
419 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33 
 
 
420 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  35.44 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  32.98 
 
 
411 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  36.29 
 
 
397 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>