More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4234 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  86.17 
 
 
412 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  86.17 
 
 
412 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  85.92 
 
 
412 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  93.64 
 
 
409 aa  797    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  54.66 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  51.96 
 
 
409 aa  428  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  51 
 
 
421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  51 
 
 
421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  51 
 
 
421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  48.01 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  47.87 
 
 
405 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  47.89 
 
 
407 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  43.83 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  43.35 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  42.5 
 
 
416 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  44.44 
 
 
403 aa  312  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  45.1 
 
 
399 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.42 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  40.39 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  42.34 
 
 
395 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.85 
 
 
400 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  40.83 
 
 
405 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  43.39 
 
 
408 aa  295  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.9 
 
 
398 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.63 
 
 
406 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  39.66 
 
 
401 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  42.56 
 
 
400 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  42.44 
 
 
410 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  41.5 
 
 
404 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  41.52 
 
 
408 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.25 
 
 
430 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.1 
 
 
409 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  39.71 
 
 
407 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  39.71 
 
 
407 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  39.35 
 
 
410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  39.36 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  41.5 
 
 
415 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  40.87 
 
 
411 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  38.57 
 
 
415 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  38.56 
 
 
400 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.7 
 
 
400 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  39.11 
 
 
414 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  36.67 
 
 
407 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  37.91 
 
 
421 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  38.9 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38 
 
 
407 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.73 
 
 
398 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  36.16 
 
 
424 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.84 
 
 
436 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  38.42 
 
 
404 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  38.27 
 
 
399 aa  252  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.77 
 
 
402 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  37.81 
 
 
400 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  38.48 
 
 
400 aa  249  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.59 
 
 
345 aa  245  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.69 
 
 
397 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.29 
 
 
394 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  35.92 
 
 
399 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  35.14 
 
 
405 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.41 
 
 
391 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  39.55 
 
 
357 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  35.78 
 
 
406 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  35.78 
 
 
406 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  35.78 
 
 
406 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  35.98 
 
 
409 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  36.93 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.02 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  34.57 
 
 
401 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.51 
 
 
405 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  36.3 
 
 
406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.78 
 
 
417 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.49 
 
 
393 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  36.67 
 
 
375 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  33.42 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.24 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  33.07 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  36.46 
 
 
406 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.95 
 
 
412 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.92 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.34 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  35.45 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.96 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  35.95 
 
 
395 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.07 
 
 
404 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  35.22 
 
 
395 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  36.22 
 
 
403 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  33.93 
 
 
398 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.58 
 
 
403 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  32.6 
 
 
405 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  31.96 
 
 
423 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.02 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.59 
 
 
411 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.16 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  31.8 
 
 
425 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.66 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.67 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.97 
 
 
426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.55 
 
 
420 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  37.43 
 
 
397 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>