More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1637 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  100 
 
 
400 aa  818    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  55.06 
 
 
399 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  54.8 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  50.88 
 
 
400 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  51.92 
 
 
401 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  50.5 
 
 
400 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  50.25 
 
 
436 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  51.61 
 
 
399 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  49.63 
 
 
400 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  48.74 
 
 
408 aa  354  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  47.12 
 
 
401 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  49.75 
 
 
410 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  48.87 
 
 
400 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  49.38 
 
 
395 aa  345  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  45.66 
 
 
408 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  45.32 
 
 
409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  44.33 
 
 
421 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  43.55 
 
 
409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  42.51 
 
 
408 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  44.19 
 
 
430 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  41.43 
 
 
401 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  41.56 
 
 
407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  43.18 
 
 
414 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  41.4 
 
 
405 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  43.26 
 
 
402 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  41.78 
 
 
397 aa  279  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  43.59 
 
 
406 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  43.59 
 
 
406 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  43.59 
 
 
406 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  47.45 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.28 
 
 
400 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  42.04 
 
 
399 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  43.04 
 
 
399 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  39.6 
 
 
407 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  41.9 
 
 
406 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  40.31 
 
 
413 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  38.81 
 
 
409 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.81 
 
 
398 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  40.5 
 
 
416 aa  255  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  39.44 
 
 
403 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  42.18 
 
 
394 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  40.36 
 
 
405 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  37.81 
 
 
409 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.59 
 
 
345 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.16 
 
 
415 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  41.6 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.73 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  39.61 
 
 
406 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  37.22 
 
 
421 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  37.22 
 
 
421 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  37.22 
 
 
421 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.19 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  40.05 
 
 
400 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  37.13 
 
 
404 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  37.91 
 
 
415 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  37.81 
 
 
412 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  37.81 
 
 
412 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.33 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  40.25 
 
 
404 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  37.56 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  39.21 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  38.18 
 
 
388 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  35.81 
 
 
409 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  40.21 
 
 
397 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  37.56 
 
 
405 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.62 
 
 
402 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  34.77 
 
 
424 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.14 
 
 
423 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.6 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.95 
 
 
412 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  36.13 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.41 
 
 
395 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.18 
 
 
407 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.18 
 
 
407 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.89 
 
 
398 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  35.98 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  36.17 
 
 
410 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.41 
 
 
400 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.32 
 
 
407 aa  210  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.09 
 
 
401 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  35.22 
 
 
406 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.71 
 
 
405 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.99 
 
 
402 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35.55 
 
 
397 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.09 
 
 
408 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  36.99 
 
 
375 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.69 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.1 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  36.13 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  35.77 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  38.82 
 
 
405 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.42 
 
 
410 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.9 
 
 
400 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.59 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.99 
 
 
419 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.9 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  33.98 
 
 
402 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.41 
 
 
393 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.03 
 
 
420 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.78 
 
 
402 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>