More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2614 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  100 
 
 		 400 aa  783    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  50 
 
 		 403 aa  355  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  48.35 
 
 		 408 aa  348  8e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  48.76 
 
 		 409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  49.47 
 
 		 405 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  46.65 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  46.35 
 
 		 424 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  45.14 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  45.21 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  46.84 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  46.06 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  43.97 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  47.42 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  44.92 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  42.75 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  44.71 
 
 		 430 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  45.86 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  44.67 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  42.75 
 
 		 408 aa  292  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  42.82 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  42.82 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  42.82 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  42.56 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  45.62 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  46.55 
 
 		 410 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  44.56 
 
 		 404 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  42.63 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  42.63 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  42.63 
 
 		 412 aa  286  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  43.92 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  44.69 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  45.3 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  43.99 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  45.05 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  44.09 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  46.17 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  41.5 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  43.88 
 
 		 414 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  44.33 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  46.58 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  46.58 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  46.58 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  42.11 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  40.91 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  41.99 
 
 		 406 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  44.33 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  42.89 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  41.71 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  41.54 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  41.54 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  42.68 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  41.44 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  46.88 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  41.46 
 
 		 402 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  42.08 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.89 
 
 		 400 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.47 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  41.21 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  38.37 
 
 		 401 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  40.05 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  41.79 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.5 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.12 
 
 		 412 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.3 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.86 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  40.46 
 
 		 423 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  38.73 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.11 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.79 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  39.8 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.85 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  40.42 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  38.35 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  37.53 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  37.02 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.31 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.56 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.31 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.07 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.07 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  38.56 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  41.22 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.05 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.72 
 
 		 402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  38.72 
 
 		 400 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  36.97 
 
 		 402 aa  216  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  37.75 
 
 		 403 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  37.31 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  41.15 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  40.63 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.59 
 
 		 410 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.99 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.47 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.98 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35.24 
 
 		 399 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.78 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.39 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.72 
 
 		 406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.97 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  36.1 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>