More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5256 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  100 
 
 
398 aa  783    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  47.12 
 
 
398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  43.62 
 
 
395 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  42.07 
 
 
395 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.93 
 
 
394 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  40.4 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.4 
 
 
405 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  39.8 
 
 
404 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  41.3 
 
 
405 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.62 
 
 
412 aa  263  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  41.3 
 
 
400 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  40.87 
 
 
406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  42.49 
 
 
408 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.12 
 
 
426 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  40.35 
 
 
404 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40 
 
 
400 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  42.71 
 
 
409 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  40.36 
 
 
401 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  39.26 
 
 
398 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.35 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  38.06 
 
 
406 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.1 
 
 
412 aa  249  6e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.16 
 
 
404 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  40.65 
 
 
401 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  41.78 
 
 
399 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  40.05 
 
 
395 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  39.8 
 
 
403 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  39.02 
 
 
436 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.48 
 
 
417 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  38.68 
 
 
399 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  36.79 
 
 
401 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.8 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40.41 
 
 
419 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.4 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  38.31 
 
 
403 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.82 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  39.56 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.19 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  37.97 
 
 
403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  40.5 
 
 
410 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  38.99 
 
 
400 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.92 
 
 
400 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  38.27 
 
 
425 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  39.9 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.07 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  37.96 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  39.34 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  40.26 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  37.82 
 
 
421 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.46 
 
 
410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  39.8 
 
 
400 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  38.66 
 
 
430 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.21 
 
 
407 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.6 
 
 
423 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.05 
 
 
411 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  36.93 
 
 
411 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  37.72 
 
 
424 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.87 
 
 
402 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.38 
 
 
406 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  35.84 
 
 
408 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.38 
 
 
406 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  40.81 
 
 
450 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.38 
 
 
406 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.59 
 
 
407 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.59 
 
 
407 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  38.5 
 
 
399 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  37.34 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.15 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  38.75 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  36.63 
 
 
409 aa  226  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  38.08 
 
 
400 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  33.93 
 
 
409 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  39.47 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  33.5 
 
 
409 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  38.54 
 
 
397 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  39.02 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  38.68 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.16 
 
 
398 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.72 
 
 
409 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  36.9 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  35.66 
 
 
416 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  33.96 
 
 
412 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  33.96 
 
 
412 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.63 
 
 
400 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.5 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.83 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.15 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  42.09 
 
 
357 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  35.77 
 
 
400 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.87 
 
 
402 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.2 
 
 
402 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.54 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  33.69 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  33.83 
 
 
400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  36.3 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  37.28 
 
 
404 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.96 
 
 
414 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  38.8 
 
 
401 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  38.87 
 
 
414 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.16 
 
 
406 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>