More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1339 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  77.89 
 
 		 408 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  100 
 
 		 416 aa  843    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  49.76 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  49.25 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  49 
 
 		 409 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  45.22 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  47.62 
 
 		 405 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  44.9 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  48.11 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  43.32 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  42.5 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  42.25 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  44.56 
 
 		 400 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  44.11 
 
 		 401 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  46.84 
 
 		 400 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  46.13 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  43.32 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  43.32 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  43.32 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  43.89 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  43.32 
 
 		 430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.9 
 
 		 409 aa  306  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  43.32 
 
 		 408 aa  305  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  42.54 
 
 		 411 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  42.51 
 
 		 412 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  42.51 
 
 		 412 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  42.61 
 
 		 404 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  42.51 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  43.29 
 
 		 399 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  44.7 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  44.7 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  44.73 
 
 		 404 aa  299  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  43.14 
 
 		 408 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.67 
 
 		 400 aa  292  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  43.4 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  43.29 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  41.6 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  41.6 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  41.6 
 
 		 406 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  41.94 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  40.66 
 
 		 421 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.01 
 
 		 406 aa  282  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  38.86 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  42.6 
 
 		 410 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  41.31 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40.97 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.77 
 
 		 406 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  38.42 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  38.86 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  42.7 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  40.59 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  39.7 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  40.05 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  39.9 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  40.5 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.45 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  42.54 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  38 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  38.25 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  36.12 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  38.48 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.61 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  39.4 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.53 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  38 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  36.48 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.39 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  39.26 
 
 		 345 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.11 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.72 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.84 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  38.06 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.25 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.22 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.86 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.38 
 
 		 411 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.47 
 
 		 397 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.92 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.03 
 
 		 410 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  34.18 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  34.18 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  35.71 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  34.18 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.67 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.68 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.93 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.68 
 
 		 395 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.98 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.67 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.93 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.19 
 
 		 426 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.15 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.1 
 
 		 423 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.62 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.68 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.73 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.16 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.46 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  35.31 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.12 
 
 		 419 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>