More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2367 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  100 
 
 		 396 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  44.19 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  42.71 
 
 		 400 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.25 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  43.63 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.03 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  36.76 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.69 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.5 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  41.73 
 
 		 376 aa  262  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.17 
 
 		 419 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.31 
 
 		 411 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.36 
 
 		 426 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  39.13 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.05 
 
 		 400 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.6 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.19 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.95 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.15 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.67 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.8 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.59 
 
 		 411 aa  232  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.27 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.54 
 
 		 402 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.4 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.89 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.12 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  35.1 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.57 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.57 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.79 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.82 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.38 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.12 
 
 		 411 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.12 
 
 		 411 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.99 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  38.72 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.01 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.82 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.01 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.01 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.23 
 
 		 414 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  36.75 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.88 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.5 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.67 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  35.14 
 
 		 408 aa  212  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  36.96 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  35.31 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.26 
 
 		 399 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  36 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.55 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  34.9 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  32.8 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.15 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  36.39 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  34.55 
 
 		 401 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.58 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  37.66 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.13 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  34.26 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.9 
 
 		 398 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  34.17 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.32 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  35.75 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.41 
 
 		 407 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  34.45 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  33.25 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  34.81 
 
 		 399 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.17 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  34.66 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.93 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  36.91 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  35.71 
 
 		 459 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  34.03 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.27 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.24 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.27 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.24 
 
 		 407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.27 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.68 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.24 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.82 
 
 		 402 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  32.75 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  33.58 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  37.47 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.93 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.96 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.94 
 
 		 388 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  34.99 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  32.75 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  35.86 
 
 		 422 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  35.49 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  32.82 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  34.77 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.84 
 
 		 407 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  34.81 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  33.94 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.25 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>