More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3533 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  100 
 
 
432 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  38.87 
 
 
396 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  41.84 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  40.97 
 
 
382 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.08 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.02 
 
 
405 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.4 
 
 
426 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.09 
 
 
408 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.15 
 
 
410 aa  216  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.82 
 
 
411 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.69 
 
 
419 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.82 
 
 
418 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  36.88 
 
 
420 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.27 
 
 
411 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.63 
 
 
395 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.96 
 
 
406 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.32 
 
 
417 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  36.59 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.44 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.19 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.5 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.19 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.37 
 
 
402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.53 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.21 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.21 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.21 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.14 
 
 
398 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  33.83 
 
 
422 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  36.34 
 
 
406 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.53 
 
 
399 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.6 
 
 
398 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  35.17 
 
 
436 aa  193  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.29 
 
 
400 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.95 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  35.05 
 
 
412 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  34.35 
 
 
399 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  35.71 
 
 
421 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35.71 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.78 
 
 
411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.78 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.11 
 
 
411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.78 
 
 
411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.78 
 
 
411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.52 
 
 
411 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.52 
 
 
411 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.61 
 
 
395 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.47 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.47 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.67 
 
 
411 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.89 
 
 
402 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.27 
 
 
411 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  32.94 
 
 
416 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.34 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.93 
 
 
408 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.33 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  32.45 
 
 
409 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  35.48 
 
 
410 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  33 
 
 
421 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  34.62 
 
 
391 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.85 
 
 
407 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.85 
 
 
407 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.63 
 
 
402 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.85 
 
 
407 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  36.58 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  35.4 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  33.77 
 
 
400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.37 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  32.99 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  33.92 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  35.34 
 
 
408 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.69 
 
 
403 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  33.17 
 
 
425 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  33.6 
 
 
412 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  33.51 
 
 
417 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  31.62 
 
 
407 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  35.03 
 
 
403 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.86 
 
 
410 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  34.59 
 
 
430 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  32.73 
 
 
401 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.21 
 
 
401 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  33.87 
 
 
404 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  35.29 
 
 
421 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  34.75 
 
 
399 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  33.59 
 
 
400 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  33.42 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  33.42 
 
 
405 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  33.17 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  33.08 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.01 
 
 
399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  32.82 
 
 
402 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  33.33 
 
 
423 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.92 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  33.83 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  33.5 
 
 
398 aa  163  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.63 
 
 
408 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  36.34 
 
 
367 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.92 
 
 
418 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  30.63 
 
 
407 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>