More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4427 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  85.9 
 
 		 376 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  100 
 
 		 382 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  43.63 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  40.71 
 
 		 432 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.28 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.8 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.44 
 
 		 426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.21 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.89 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.62 
 
 		 406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.3 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.91 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.53 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40.4 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  37.03 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.34 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.84 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.29 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.87 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.87 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.51 
 
 		 411 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.04 
 
 		 400 aa  195  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.51 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.51 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.69 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.53 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.01 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.19 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.2 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.04 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  35.86 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.91 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.24 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.1 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  35.06 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  35.53 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.59 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.51 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.54 
 
 		 410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  37.19 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  34.9 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  35.9 
 
 		 402 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.43 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.32 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.32 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.99 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  35.25 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.91 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  35.75 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.43 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  33.42 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  33.42 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.15 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  35.77 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.3 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.92 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  33.93 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.53 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.3 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  36.47 
 
 		 412 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  31.98 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  36.28 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.12 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  36.71 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.85 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  35.49 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  35.49 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  35.49 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  37.79 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  31.71 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  31.71 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.68 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  31.71 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  32.72 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  32.92 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.6 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  32.8 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  35.51 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  34.79 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  33.51 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.28 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  33.42 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  31.44 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  34.53 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  38.73 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.42 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.42 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.42 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  31.44 
 
 		 404 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.06 
 
 		 401 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.92 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  39.06 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  35.13 
 
 		 415 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.74 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  31.44 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.51 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  34.09 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>