More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1748 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  100 
 
 		 373 aa  746    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  49.59 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  47.8 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  41.78 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  41.3 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  41.37 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  40.54 
 
 		 412 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  38.75 
 
 		 416 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  43.06 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  41.83 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  38.56 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  40.52 
 
 		 416 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.79 
 
 		 426 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.67 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.07 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.31 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  40.61 
 
 		 411 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.92 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  35.81 
 
 		 424 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  40.27 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  40.27 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  39.93 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  39.53 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.13 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.93 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  39.93 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.67 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.36 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.79 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  42.12 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  38.91 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.75 
 
 		 388 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.75 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.07 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.44 
 
 		 402 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.06 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.9 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  37.53 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.5 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.71 
 
 		 430 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.34 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  38.5 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.33 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  39.87 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.59 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.14 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.29 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.87 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.61 
 
 		 401 aa  182  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.39 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  35.41 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.87 
 
 		 400 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.69 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.2 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.17 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  36.83 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.26 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  35.61 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  35.61 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  35.61 
 
 		 447 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.54 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.48 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.66 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.49 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  36.28 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  36.15 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  36.17 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  34.86 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  34.4 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.17 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  35.94 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  34.72 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.82 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.2 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  33.06 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  33.33 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.36 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  34.58 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  36.71 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  34.59 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.74 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  33.76 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33.79 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  32.85 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  38.73 
 
 		 389 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.23 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  36.56 
 
 		 438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  38.54 
 
 		 408 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.19 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.78 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4325  cytochrome P450  32.62 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  35.4 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  34.97 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1302  cytochrome P450  30.7 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  34.5 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  34.88 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.08 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  38.51 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.08 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  33.73 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>