More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1257 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  100 
 
 		 396 aa  800    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  47.73 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  41.53 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  40.65 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  38.5 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  37.1 
 
 		 412 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  41.35 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  37.47 
 
 		 409 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  39.01 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  34.51 
 
 		 416 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  36.77 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  37.36 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.93 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.92 
 
 		 402 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.04 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.5 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.24 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  33.51 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.19 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.02 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.06 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.14 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.49 
 
 		 410 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.71 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.41 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.85 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.72 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.82 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.82 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.66 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  35.41 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.93 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.01 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.97 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.04 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.04 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.75 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.62 
 
 		 398 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  36 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.75 
 
 		 411 aa  189  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.04 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.04 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  37.39 
 
 		 402 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.13 
 
 		 430 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.75 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  35.75 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.08 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  40.59 
 
 		 409 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33.91 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  35.91 
 
 		 436 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.83 
 
 		 410 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  34.57 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.16 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  37.31 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  34.22 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.47 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  34.48 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.42 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  33.61 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.31 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  35.88 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.47 
 
 		 412 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  36.69 
 
 		 401 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.52 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.42 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.59 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  38.67 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.5 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  34.18 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  35.85 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  35.11 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.52 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.57 
 
 		 407 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.57 
 
 		 407 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  36.63 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  35.01 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.94 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.08 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.29 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.71 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.75 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.75 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.36 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33.6 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.19 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  30.43 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.41 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.21 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  34.81 
 
 		 409 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  37.85 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  33.06 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  34.82 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.53 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  34.2 
 
 		 407 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.24 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  34.04 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  33.71 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  33.71 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  33.51 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>