More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1259 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  100 
 
 
422 aa  855    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  46.17 
 
 
423 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  39.48 
 
 
420 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  41.45 
 
 
421 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.05 
 
 
412 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39 
 
 
408 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.15 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.7 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.25 
 
 
410 aa  243  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.49 
 
 
400 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  38.52 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.3 
 
 
426 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.75 
 
 
412 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.12 
 
 
402 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.76 
 
 
411 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.66 
 
 
418 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40 
 
 
400 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.9 
 
 
400 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  38.85 
 
 
399 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.51 
 
 
420 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.15 
 
 
419 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.93 
 
 
414 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.59 
 
 
394 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.09 
 
 
406 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  37.82 
 
 
389 aa  216  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.63 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.74 
 
 
409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.44 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34.07 
 
 
398 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  38.13 
 
 
400 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.82 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.53 
 
 
400 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.25 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.61 
 
 
395 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.25 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.25 
 
 
411 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.75 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.25 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.92 
 
 
391 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.75 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  35.82 
 
 
408 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35 
 
 
411 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.11 
 
 
402 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.73 
 
 
401 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.77 
 
 
395 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.35 
 
 
407 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  37.53 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  35.81 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.83 
 
 
402 aa  201  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.5 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.92 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  38.96 
 
 
436 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  35.13 
 
 
409 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  33.77 
 
 
404 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  33.74 
 
 
417 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.34 
 
 
388 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.38 
 
 
398 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  35.58 
 
 
402 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  36.48 
 
 
403 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.64 
 
 
401 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.2 
 
 
410 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.86 
 
 
396 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.68 
 
 
405 aa  192  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  33.67 
 
 
399 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.7 
 
 
407 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.7 
 
 
407 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  36.39 
 
 
401 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.84 
 
 
399 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  36.98 
 
 
417 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  35.47 
 
 
401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32.71 
 
 
390 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  34.86 
 
 
406 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  33.83 
 
 
432 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.08 
 
 
399 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.45 
 
 
410 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  35.48 
 
 
409 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.96 
 
 
411 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  34.11 
 
 
416 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  37.53 
 
 
373 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  34.38 
 
 
423 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  36.71 
 
 
399 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.51 
 
 
403 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  35.15 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  35.15 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  34.9 
 
 
404 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  35.15 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  33.94 
 
 
402 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  32.66 
 
 
406 aa  187  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  34.31 
 
 
400 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.86 
 
 
412 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.86 
 
 
412 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  32.59 
 
 
413 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.86 
 
 
411 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  39.07 
 
 
367 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.59 
 
 
400 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  34.99 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  34.35 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  36.88 
 
 
357 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  33.42 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.85 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>