More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3894 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  100 
 
 		 403 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  44.64 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  41.69 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.35 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  38.75 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.53 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.57 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.57 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.19 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.24 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  31.94 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.46 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.75 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  37.59 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.54 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.9 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.01 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  35.59 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  37.24 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  39.39 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.03 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.75 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  33.75 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  37.17 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.35 
 
 		 399 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.74 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.68 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  33.88 
 
 		 409 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.29 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.49 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  30.77 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  30.77 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  35.95 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  37.16 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.49 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.32 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  28.5 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  33.8 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.5 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  33.25 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.71 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.22 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.29 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  36.08 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.28 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.99 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.22 
 
 		 411 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.23 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  34.56 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  35.94 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.33 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  33.88 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.42 
 
 		 414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.84 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  29.63 
 
 		 411 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  34.24 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.43 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  34.48 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  34.09 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  35.99 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.59 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  39.21 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.59 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.59 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.01 
 
 		 436 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  34.23 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.64 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  34.93 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.49 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.11 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  35.26 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  34.79 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  34.15 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  32.7 
 
 		 423 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.25 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  33.6 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.68 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  34.05 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  34.38 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  32.75 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  36.21 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  35.23 
 
 		 415 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  34.31 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  34.33 
 
 		 375 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.97 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.36 
 
 		 430 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.13 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  29.35 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  32.99 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  32.51 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.68 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  34.68 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.67 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.67 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  33.6 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  34.48 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  34.82 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.76 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  33.25 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  38.46 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>