More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3059 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  100 
 
 		 417 aa  819    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  38.58 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  39.34 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  38.87 
 
 		 416 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  36.1 
 
 		 409 aa  222  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  39.25 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  41.19 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  37.7 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  36.48 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  34.78 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  37.25 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.12 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  36.98 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  38.5 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  41.77 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.39 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  35.75 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  36.15 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.69 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.83 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.65 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.75 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.48 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.1 
 
 		 400 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.55 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.55 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.55 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.48 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.58 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.05 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.06 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.25 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.8 
 
 		 412 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.2 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.2 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.29 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  36.41 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.09 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  34.89 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.61 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.61 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  35.6 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.52 
 
 		 400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.1 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.89 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.1 
 
 		 407 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.81 
 
 		 417 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  35.03 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.86 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.84 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  37.47 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  35.34 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.92 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.46 
 
 		 406 aa  169  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  38.17 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  34.02 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.94 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  34.91 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.36 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.27 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  35.64 
 
 		 407 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.77 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.14 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  35.53 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  37.35 
 
 		 443 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.54 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.71 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  35.62 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.16 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  38.64 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  41.47 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.46 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  36.16 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  38.64 
 
 		 408 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.47 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  34.64 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  40.28 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  36.42 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.8 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  34.29 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.52 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.31 
 
 		 447 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  36.39 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.74 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.01 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  35.5 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  39.87 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.01 
 
 		 447 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  36.45 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  35.8 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  33.91 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  30.4 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2431  cytochrome P450  34.76 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.79 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  40.75 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.48 
 
 		 402 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  34.02 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>