More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2724 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  56.3 
 
 
412 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  51.6 
 
 
416 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  43.84 
 
 
412 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  42.93 
 
 
409 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  42.33 
 
 
409 aa  310  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  43.25 
 
 
366 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  38.96 
 
 
408 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  43.06 
 
 
373 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  37.14 
 
 
416 aa  249  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  37.91 
 
 
424 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  37.53 
 
 
367 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.83 
 
 
405 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.57 
 
 
426 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.96 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.8 
 
 
412 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.75 
 
 
423 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.36 
 
 
400 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.37 
 
 
412 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.7 
 
 
400 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.47 
 
 
418 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  37.7 
 
 
417 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  35.47 
 
 
395 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.98 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  34.78 
 
 
399 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  33.51 
 
 
396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.99 
 
 
420 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.96 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.3 
 
 
430 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.67 
 
 
402 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.86 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.15 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  35.13 
 
 
422 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.47 
 
 
417 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  36.78 
 
 
400 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.08 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  33 
 
 
408 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.28 
 
 
419 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  32.64 
 
 
401 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  36.68 
 
 
376 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.74 
 
 
447 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.74 
 
 
447 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.74 
 
 
447 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  34.53 
 
 
421 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.78 
 
 
407 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.78 
 
 
407 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.75 
 
 
401 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.99 
 
 
411 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  34.38 
 
 
400 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.25 
 
 
411 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  38.82 
 
 
443 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.46 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  30.75 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  33.42 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.92 
 
 
411 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.01 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  32.32 
 
 
400 aa  182  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  38.2 
 
 
444 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.74 
 
 
420 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  33.76 
 
 
400 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.26 
 
 
411 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.5 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  33.5 
 
 
459 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  34.11 
 
 
391 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  32.67 
 
 
403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.51 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.26 
 
 
411 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.26 
 
 
411 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  33.85 
 
 
409 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  34.29 
 
 
405 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.03 
 
 
407 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.01 
 
 
411 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  36.73 
 
 
407 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  36.73 
 
 
407 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  31.98 
 
 
407 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  30.65 
 
 
409 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.68 
 
 
410 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.98 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.98 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  32.57 
 
 
404 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  33.93 
 
 
382 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  34.07 
 
 
421 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  32.47 
 
 
403 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  33.25 
 
 
399 aa  176  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  34.05 
 
 
413 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.41 
 
 
436 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  28.87 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  28.87 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  32.62 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  33.33 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  31.27 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  33.33 
 
 
400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  28.87 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  33.5 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.48 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  32.56 
 
 
400 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  33.74 
 
 
402 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.08 
 
 
406 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.54 
 
 
411 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>