More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4185 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  100 
 
 
412 aa  828    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  54.59 
 
 
409 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  51.11 
 
 
416 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  43.84 
 
 
409 aa  332  6e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  42.54 
 
 
412 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  44.86 
 
 
366 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  39.27 
 
 
409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  39.9 
 
 
408 aa  260  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  38.56 
 
 
373 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  38.33 
 
 
424 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  41.71 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  37.7 
 
 
367 aa  226  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  39.01 
 
 
396 aa  220  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.96 
 
 
405 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  36.48 
 
 
417 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  41.18 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.87 
 
 
400 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.19 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.66 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.34 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.29 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.66 
 
 
408 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  37.69 
 
 
402 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  35.29 
 
 
420 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.23 
 
 
395 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.36 
 
 
426 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.91 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.34 
 
 
398 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.73 
 
 
395 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.14 
 
 
400 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.66 
 
 
398 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  39.51 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  41.36 
 
 
407 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  41.36 
 
 
407 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  34.18 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.3 
 
 
410 aa  183  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  37.76 
 
 
409 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.61 
 
 
407 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.41 
 
 
388 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.71 
 
 
406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.73 
 
 
410 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.06 
 
 
394 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.36 
 
 
436 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.34 
 
 
419 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.66 
 
 
400 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  33.87 
 
 
417 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.79 
 
 
411 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.79 
 
 
411 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.89 
 
 
407 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.64 
 
 
418 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  36.47 
 
 
382 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  33.42 
 
 
408 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2327  cytochrome P450-like protein  32.31 
 
 
408 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.283522  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.52 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.52 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.03 
 
 
411 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  35.41 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.52 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.93 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.06 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  38.69 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.25 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.25 
 
 
399 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  33.81 
 
 
401 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.98 
 
 
411 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.88 
 
 
411 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.56 
 
 
411 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  34.19 
 
 
421 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.05 
 
 
450 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.18 
 
 
405 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  35.97 
 
 
397 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  34.06 
 
 
400 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.62 
 
 
405 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  32.7 
 
 
422 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  34.46 
 
 
430 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  34.6 
 
 
405 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.05 
 
 
402 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  39.4 
 
 
406 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  39.38 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.94 
 
 
399 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  33.42 
 
 
395 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  34.05 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  33.6 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  38 
 
 
443 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  32.18 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  33.61 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.22 
 
 
394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  33.5 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  32.82 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  34.43 
 
 
357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.8 
 
 
447 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  33.8 
 
 
407 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.8 
 
 
447 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  33.8 
 
 
407 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  34.07 
 
 
404 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  35.71 
 
 
376 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.52 
 
 
408 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  34.16 
 
 
399 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>