More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4902 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  85.9 
 
 
382 aa  642    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  100 
 
 
376 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  41.73 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  41.84 
 
 
432 aa  239  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.54 
 
 
405 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.42 
 
 
412 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.77 
 
 
426 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.61 
 
 
408 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.27 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.25 
 
 
412 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.31 
 
 
419 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.04 
 
 
411 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.52 
 
 
406 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.41 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.47 
 
 
395 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.66 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.77 
 
 
395 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.03 
 
 
418 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.93 
 
 
411 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  35.47 
 
 
409 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.4 
 
 
411 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  38.1 
 
 
398 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  36.68 
 
 
409 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.16 
 
 
411 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.16 
 
 
411 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.7 
 
 
417 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.89 
 
 
411 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.04 
 
 
400 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.59 
 
 
402 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.89 
 
 
411 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.1 
 
 
423 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.34 
 
 
400 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.72 
 
 
414 aa  185  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.63 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.63 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  35.1 
 
 
416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  34.75 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.11 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.18 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.25 
 
 
405 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.66 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  37.63 
 
 
403 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  35.43 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.54 
 
 
410 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  34.73 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.9 
 
 
401 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.59 
 
 
402 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.77 
 
 
407 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.77 
 
 
407 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  32.8 
 
 
402 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.77 
 
 
407 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  34.46 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.19 
 
 
412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.2 
 
 
402 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.07 
 
 
408 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  37.19 
 
 
422 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.36 
 
 
399 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.08 
 
 
399 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.07 
 
 
394 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.76 
 
 
388 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.55 
 
 
401 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.77 
 
 
398 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  34.38 
 
 
414 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35 
 
 
402 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  34.49 
 
 
406 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  34.49 
 
 
406 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  34.49 
 
 
406 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  32.39 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  32.39 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  37.13 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.01 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  34.53 
 
 
375 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  34.41 
 
 
405 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  34.04 
 
 
400 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.49 
 
 
415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  34.68 
 
 
404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.81 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  40.06 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  31.17 
 
 
404 aa  166  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  35.09 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  32.38 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  38.28 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  35.4 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  33.86 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  36.13 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.61 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  34.31 
 
 
410 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  35.71 
 
 
412 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  35.48 
 
 
409 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  33.97 
 
 
403 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.31 
 
 
419 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.68 
 
 
418 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  30.89 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  30.89 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  32.82 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.26 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  30.89 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  30.21 
 
 
409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  32.55 
 
 
405 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>