More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2895 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  100 
 
 
401 aa  797    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  66.25 
 
 
406 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  65.49 
 
 
403 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  65.68 
 
 
403 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  63.22 
 
 
404 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  44.03 
 
 
398 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.22 
 
 
394 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  41.77 
 
 
425 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  41.04 
 
 
399 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  41.35 
 
 
391 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.25 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.65 
 
 
398 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  39.07 
 
 
402 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.44 
 
 
395 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.46 
 
 
402 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.75 
 
 
408 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.19 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  39.52 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.97 
 
 
400 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  42.49 
 
 
406 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.28 
 
 
405 aa  226  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.05 
 
 
426 aa  226  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  38.83 
 
 
401 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.04 
 
 
404 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  39.8 
 
 
400 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  42.72 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  39.34 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  38.52 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.63 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.28 
 
 
411 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  38.86 
 
 
409 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.85 
 
 
411 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.36 
 
 
402 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  38.08 
 
 
395 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  37.78 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.13 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  38.46 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  35.73 
 
 
409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  37.88 
 
 
407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  38.44 
 
 
410 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.91 
 
 
406 aa  212  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.93 
 
 
401 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.46 
 
 
408 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  36.34 
 
 
408 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.23 
 
 
403 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  39.8 
 
 
395 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  38.25 
 
 
430 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.68 
 
 
400 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.6 
 
 
406 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.6 
 
 
406 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.6 
 
 
406 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  35.52 
 
 
421 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  37.64 
 
 
393 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  39.14 
 
 
394 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.41 
 
 
423 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  38.62 
 
 
399 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.18 
 
 
402 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  37.87 
 
 
424 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  35.4 
 
 
397 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.18 
 
 
407 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.18 
 
 
407 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.1 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  35.28 
 
 
405 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.85 
 
 
411 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  38.4 
 
 
405 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.85 
 
 
411 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.85 
 
 
411 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.47 
 
 
436 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.79 
 
 
412 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  33.59 
 
 
411 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.21 
 
 
414 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  37.28 
 
 
407 aa  202  9e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.59 
 
 
411 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  33.08 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  39.41 
 
 
345 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.93 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.59 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.54 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  34.66 
 
 
409 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  35.64 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.37 
 
 
400 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  39.3 
 
 
450 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.57 
 
 
420 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  36.83 
 
 
410 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.88 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.49 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.1 
 
 
411 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  35.15 
 
 
415 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.19 
 
 
399 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.91 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.73 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  38.29 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  38.6 
 
 
400 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.05 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.13 
 
 
410 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  34.99 
 
 
412 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  34.99 
 
 
412 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  39.63 
 
 
402 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  34.99 
 
 
412 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.65 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>