More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2750 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  100 
 
 
416 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  56.93 
 
 
409 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  38.04 
 
 
416 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  39.85 
 
 
412 aa  262  8e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  42.22 
 
 
366 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  37.14 
 
 
409 aa  249  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  40.65 
 
 
396 aa  246  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  39.9 
 
 
408 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  39.53 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  36.86 
 
 
424 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  37.41 
 
 
409 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  41.71 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  40.52 
 
 
373 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  38.87 
 
 
417 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.69 
 
 
400 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.19 
 
 
401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.15 
 
 
402 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.6 
 
 
411 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.61 
 
 
405 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.85 
 
 
406 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.05 
 
 
412 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.06 
 
 
423 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.36 
 
 
417 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.6 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.51 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.33 
 
 
400 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.65 
 
 
412 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.77 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.95 
 
 
420 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.08 
 
 
419 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  37.28 
 
 
436 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.17 
 
 
398 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  36.18 
 
 
399 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.51 
 
 
426 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.67 
 
 
414 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  33.25 
 
 
406 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  36.15 
 
 
400 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30 
 
 
411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.12 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.06 
 
 
399 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.3 
 
 
395 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  34.5 
 
 
421 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.84 
 
 
411 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.84 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  31.85 
 
 
396 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.84 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.84 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  34.15 
 
 
411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  29.27 
 
 
411 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  34.45 
 
 
409 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  34.96 
 
 
418 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  34.49 
 
 
407 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  32.35 
 
 
416 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.54 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  35.17 
 
 
399 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  32.21 
 
 
408 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  32.82 
 
 
408 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.51 
 
 
411 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.67 
 
 
394 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  33.25 
 
 
430 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.34 
 
 
447 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.34 
 
 
447 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.34 
 
 
447 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  31.28 
 
 
404 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  33.42 
 
 
400 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.93 
 
 
411 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.24 
 
 
407 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.24 
 
 
407 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.24 
 
 
407 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.13 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.78 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  31.46 
 
 
401 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  34.37 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  31.93 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  34.15 
 
 
415 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.17 
 
 
401 aa  172  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  33.16 
 
 
408 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  32.73 
 
 
409 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.32 
 
 
411 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.87 
 
 
420 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  32.9 
 
 
407 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34.57 
 
 
398 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  32.9 
 
 
407 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  32.19 
 
 
395 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  34.16 
 
 
400 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  33.59 
 
 
400 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  32.5 
 
 
398 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  37.69 
 
 
423 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  33.51 
 
 
403 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  30.54 
 
 
403 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  35.26 
 
 
403 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.3 
 
 
400 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  35.88 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  30.77 
 
 
407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  33.51 
 
 
395 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.66 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  32.37 
 
 
402 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  32.12 
 
 
405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  31.85 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  34.2 
 
 
431 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>