More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2115 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  100 
 
 		 430 aa  825    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  42.55 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  47.06 
 
 		 450 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  39.61 
 
 		 417 aa  256  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  40.68 
 
 		 409 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  40.39 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  39.76 
 
 		 431 aa  229  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  38.48 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  38.48 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  38.48 
 
 		 447 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.95 
 
 		 407 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  39.58 
 
 		 435 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.95 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.95 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  39.76 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  39.29 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  38.73 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  39.95 
 
 		 418 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  38.46 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  39.61 
 
 		 413 aa  216  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  38.2 
 
 		 411 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.56 
 
 		 398 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.3 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.74 
 
 		 410 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  39.7 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  36.94 
 
 		 438 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.06 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  39.66 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  37.28 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.81 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.7 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  39.08 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  39.39 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  40.85 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.78 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  39.44 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  37.13 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  42.03 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.02 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.09 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.33 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.02 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.02 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  38.89 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  38.01 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.21 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.02 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.02 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.4 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.71 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.02 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  40.44 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  37.77 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  35.39 
 
 		 415 aa  190  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  40.84 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.53 
 
 		 399 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  37.27 
 
 		 417 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.29 
 
 		 410 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.96 
 
 		 427 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.68 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  37.03 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.29 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.54 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  40.18 
 
 		 414 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  40.91 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  38.32 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  41.2 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  39.2 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  41.03 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.8 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  39.31 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  37.46 
 
 		 396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.24 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.43 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  37.1 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.49 
 
 		 406 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  37.1 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.09 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.15 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  41.67 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.36 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.2 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.1 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.26 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  36.07 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  36.91 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.08 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  37.01 
 
 		 387 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  32.84 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32630  cytochrome P450  38.01 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301042  hitchhiker  0.00539785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.66 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1932  cytochrome P450  31.33 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.53 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.9 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.91 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  36.89 
 
 		 408 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.86 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  35.6 
 
 		 398 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  41.38 
 
 		 400 aa  173  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.03 
 
 		 405 aa  173  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>