More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1901 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  100 
 
 
411 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  55.42 
 
 
414 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  44.23 
 
 
410 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  40.25 
 
 
404 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.55 
 
 
405 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.4 
 
 
401 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.48 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.69 
 
 
412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.42 
 
 
410 aa  252  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.9 
 
 
411 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.28 
 
 
411 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  36.41 
 
 
420 aa  249  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.31 
 
 
411 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  39.14 
 
 
408 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  40.15 
 
 
429 aa  245  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37 
 
 
411 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.5 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  39.24 
 
 
409 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  38.14 
 
 
406 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.56 
 
 
411 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.56 
 
 
411 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  37.38 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.31 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  38.97 
 
 
417 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  37.38 
 
 
411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.8 
 
 
411 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  39.19 
 
 
417 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.76 
 
 
405 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.34 
 
 
408 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  38.83 
 
 
408 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.22 
 
 
411 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.61 
 
 
407 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.61 
 
 
407 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.61 
 
 
407 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.1 
 
 
423 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.27 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.11 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  38.93 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  38.97 
 
 
400 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.85 
 
 
398 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.86 
 
 
411 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.1 
 
 
407 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.21 
 
 
392 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  39.19 
 
 
407 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  36.45 
 
 
402 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  39.95 
 
 
396 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.88 
 
 
412 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.47 
 
 
423 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.69 
 
 
411 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  36.36 
 
 
406 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.84 
 
 
388 aa  226  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  38.4 
 
 
413 aa  225  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.36 
 
 
418 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.91 
 
 
405 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  38.26 
 
 
436 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  38.81 
 
 
410 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.27 
 
 
426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  37.38 
 
 
412 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.2 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  40.05 
 
 
404 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  34.58 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  37.37 
 
 
409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  38.79 
 
 
418 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  36.96 
 
 
417 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.79 
 
 
414 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.7 
 
 
402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.97 
 
 
394 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.1 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.44 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  38.07 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  35.95 
 
 
421 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40.58 
 
 
400 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.82 
 
 
419 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  37.2 
 
 
404 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.96 
 
 
416 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40.96 
 
 
400 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.44 
 
 
402 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.68 
 
 
398 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  37.22 
 
 
398 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  35.24 
 
 
395 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.5 
 
 
399 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  41.83 
 
 
421 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.38 
 
 
406 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.38 
 
 
406 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.1 
 
 
427 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  43.62 
 
 
417 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.38 
 
 
406 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  40.2 
 
 
423 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  37.44 
 
 
417 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  34.9 
 
 
402 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  36.76 
 
 
443 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  34.9 
 
 
402 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  34.9 
 
 
402 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.05 
 
 
423 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  37.32 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  35.85 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.84 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  42.98 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  33.59 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>