More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0160 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  100 
 
 		 413 aa  828    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  87.41 
 
 		 417 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  66.83 
 
 		 413 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  65.7 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  65.94 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  66.43 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  65.46 
 
 		 411 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  66.99 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  51.79 
 
 		 418 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  47.94 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0401  cytochrome P450  43.58 
 
 		 421 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.21 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  37.32 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.51 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.16 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.22 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.16 
 
 		 407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.16 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.16 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.71 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.69 
 
 		 399 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  36.24 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.74 
 
 		 409 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.91 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.29 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.01 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  38.2 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.35 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.28 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.17 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  36.01 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  35.99 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.65 
 
 		 426 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.38 
 
 		 410 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.16 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.46 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  38.33 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  34.4 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.78 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.84 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  37.44 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.6 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  38 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.1 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  37.8 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.41 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.68 
 
 		 411 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.52 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.98 
 
 		 411 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  35.85 
 
 		 411 aa  209  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.67 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.11 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.68 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.67 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.38 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  34.1 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  35.53 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.98 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  32.07 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.3 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.3 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  36.25 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.34 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.6 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.24 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  34.22 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.66 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  37.1 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  36.43 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  37.89 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.38 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.4 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  30.83 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.95 
 
 		 402 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.66 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.86 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  36.43 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.08 
 
 		 417 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  38.68 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.33 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.54 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  32.03 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.58 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.79 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.22 
 
 		 392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.53 
 
 		 399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  35.9 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  33.97 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  36.66 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  34.06 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  33.94 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.58 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  36.72 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  34.63 
 
 		 430 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.85 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.1 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  38.1 
 
 		 408 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  33.17 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  33.92 
 
 		 414 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>