More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5420 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  100 
 
 
468 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  74.76 
 
 
413 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  67.48 
 
 
417 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  66.99 
 
 
413 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  61.02 
 
 
412 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  60.53 
 
 
412 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  60.29 
 
 
411 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  60.34 
 
 
417 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  49.88 
 
 
418 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  46.28 
 
 
442 aa  364  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0401  cytochrome P450  39.42 
 
 
421 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.56 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.04 
 
 
407 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.04 
 
 
407 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.04 
 
 
407 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.4 
 
 
402 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.59 
 
 
401 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.01 
 
 
398 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.52 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.72 
 
 
423 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.44 
 
 
419 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.8 
 
 
399 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.29 
 
 
412 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  40.1 
 
 
416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.02 
 
 
405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.19 
 
 
408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.92 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  36.1 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.14 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.97 
 
 
417 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.53 
 
 
409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.25 
 
 
420 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.94 
 
 
411 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  39.8 
 
 
411 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.84 
 
 
426 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  38.8 
 
 
411 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  40 
 
 
411 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  38.83 
 
 
411 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.96 
 
 
402 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.36 
 
 
417 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  39.12 
 
 
411 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38.49 
 
 
411 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  36.71 
 
 
411 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.14 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.14 
 
 
411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.7 
 
 
400 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  38.14 
 
 
411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.13 
 
 
407 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.33 
 
 
407 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.63 
 
 
410 aa  203  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.46 
 
 
417 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.8 
 
 
411 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.8 
 
 
411 aa  202  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.76 
 
 
405 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  34.72 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.23 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.26 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.65 
 
 
399 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  35.01 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.66 
 
 
424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.53 
 
 
402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  40.36 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.15 
 
 
380 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.76 
 
 
406 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.72 
 
 
409 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.99 
 
 
404 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40.21 
 
 
418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.28 
 
 
388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.89 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.8 
 
 
412 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.81 
 
 
417 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  38.99 
 
 
421 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.22 
 
 
422 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.47 
 
 
401 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.07 
 
 
414 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  34.91 
 
 
394 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32.66 
 
 
436 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  35.8 
 
 
423 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  33.51 
 
 
410 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.87 
 
 
414 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  34.32 
 
 
430 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  34.34 
 
 
399 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  34.64 
 
 
408 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.44 
 
 
419 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.42 
 
 
407 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.08 
 
 
402 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.55 
 
 
400 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  31.85 
 
 
421 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.08 
 
 
402 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.32 
 
 
409 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.53 
 
 
409 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.25 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  32.75 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  34.2 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  33.87 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  29.58 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  32.1 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.75 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>