More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2162 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  100 
 
 
392 aa  789    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  60.82 
 
 
398 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  61.6 
 
 
398 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  44.31 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  42 
 
 
427 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  42.71 
 
 
395 aa  292  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  43.86 
 
 
395 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  42.61 
 
 
395 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  40 
 
 
404 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  40 
 
 
404 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  40 
 
 
404 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  40.67 
 
 
380 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  42.6 
 
 
402 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  42.6 
 
 
402 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  42.6 
 
 
402 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  38.65 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  40.3 
 
 
402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  42.29 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  40.56 
 
 
402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  44.29 
 
 
398 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  42.53 
 
 
388 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  41.5 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  41.5 
 
 
405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  41.5 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  39.41 
 
 
401 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  39.7 
 
 
407 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  39.41 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  39.41 
 
 
401 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2229  cytochrome P450  38.89 
 
 
412 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  42.09 
 
 
402 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  39.33 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6442  cytochrome P450 CYP109C2  42.78 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175786  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  39.61 
 
 
411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  42.29 
 
 
401 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  39.61 
 
 
411 aa  270  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  40.15 
 
 
400 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.33 
 
 
411 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11282  cytochrome P450 130 cyp130  39.58 
 
 
405 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.112897  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  39.9 
 
 
400 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  39.9 
 
 
400 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  39.04 
 
 
411 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  39.17 
 
 
411 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  39.04 
 
 
411 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  37.5 
 
 
398 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  37.97 
 
 
398 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  39.07 
 
 
405 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  39.07 
 
 
405 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  39.07 
 
 
405 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  38.76 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  40.05 
 
 
399 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  39.17 
 
 
411 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  38.76 
 
 
411 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  39 
 
 
401 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  42.37 
 
 
409 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.77 
 
 
402 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  40.21 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  37.93 
 
 
396 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  39.65 
 
 
411 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  37.63 
 
 
398 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  39.65 
 
 
394 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  39.9 
 
 
394 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  37.53 
 
 
403 aa  262  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  39.9 
 
 
401 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  40.79 
 
 
404 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  40.92 
 
 
417 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  37.05 
 
 
411 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4465  cytochrome P450  38.34 
 
 
413 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  36.5 
 
 
408 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  38.6 
 
 
414 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  39.9 
 
 
417 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  42.55 
 
 
395 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  39.74 
 
 
408 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3778  cytochrome P450  39.58 
 
 
403 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.85 
 
 
411 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  36.79 
 
 
408 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  38.99 
 
 
393 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  37.47 
 
 
396 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3976  cytochrome P450  40.05 
 
 
398 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424907  normal  0.0390566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  38.61 
 
 
402 aa  255  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  36.69 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  38.87 
 
 
403 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  38.13 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  37 
 
 
413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.45 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  40.91 
 
 
398 aa  253  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3962  cytochrome P450  39.79 
 
 
398 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4036  cytochrome P450  39.79 
 
 
398 aa  252  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  36.82 
 
 
406 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.18 
 
 
411 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  36.82 
 
 
418 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  36.82 
 
 
406 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  42.22 
 
 
406 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.67 
 
 
412 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.7 
 
 
412 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2569  cytochrome P450  37.57 
 
 
397 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2532  cytochrome P450  37.57 
 
 
397 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.225488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2577  cytochrome P450  37.57 
 
 
397 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591553  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  38.82 
 
 
404 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  35.66 
 
 
411 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.29 
 
 
407 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>