More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0869 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  100 
 
 
415 aa  850    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  62.41 
 
 
414 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  63.33 
 
 
414 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  64.55 
 
 
414 aa  527  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  48.85 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  48.71 
 
 
387 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  47.96 
 
 
393 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  47.96 
 
 
393 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  47.03 
 
 
407 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  45.86 
 
 
390 aa  328  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  40.83 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  41.21 
 
 
410 aa  298  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.8 
 
 
399 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.39 
 
 
405 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  41.25 
 
 
412 aa  292  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.3 
 
 
402 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  40.16 
 
 
396 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  36.71 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.16 
 
 
410 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.25 
 
 
402 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.39 
 
 
398 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.36 
 
 
399 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.41 
 
 
401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.94 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.28 
 
 
405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  34.84 
 
 
402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  33.51 
 
 
400 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.31 
 
 
402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.75 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.46 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.75 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  35.08 
 
 
400 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  33.5 
 
 
398 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.33 
 
 
410 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  34.82 
 
 
399 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.08 
 
 
407 aa  206  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.09 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.17 
 
 
417 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.5 
 
 
411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.77 
 
 
411 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  32.83 
 
 
407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  32.83 
 
 
407 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.94 
 
 
411 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  31.54 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.17 
 
 
411 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  33.67 
 
 
409 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.61 
 
 
380 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.92 
 
 
419 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  30.26 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  30.26 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.56 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  34.04 
 
 
418 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.02 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.54 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.12 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.3 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  31.07 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  32.09 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.3 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.25 
 
 
412 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  34.24 
 
 
406 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  33.91 
 
 
413 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.64 
 
 
412 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.69 
 
 
402 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  36.15 
 
 
411 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.33 
 
 
408 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  29 
 
 
411 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  29.17 
 
 
407 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.15 
 
 
412 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  34.78 
 
 
408 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  31.82 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  33.24 
 
 
394 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  31.49 
 
 
419 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  32.49 
 
 
417 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  31.92 
 
 
405 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  32.06 
 
 
406 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  30.63 
 
 
436 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  33.25 
 
 
414 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.36 
 
 
407 aa  186  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  30.67 
 
 
418 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.09 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  31.34 
 
 
401 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  33.52 
 
 
443 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.8 
 
 
398 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  31.16 
 
 
406 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  34.15 
 
 
407 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  34.84 
 
 
442 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  32.23 
 
 
413 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  32.33 
 
 
421 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  32.5 
 
 
417 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.91 
 
 
412 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.76 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  33.75 
 
 
404 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  33.15 
 
 
419 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  32.85 
 
 
447 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  33.68 
 
 
411 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.09 
 
 
429 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  33.33 
 
 
400 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  32.79 
 
 
392 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>