More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3536 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  100 
 
 
391 aa  777    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  55.03 
 
 
402 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  48.87 
 
 
410 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  45.36 
 
 
399 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  43.21 
 
 
412 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  42.14 
 
 
405 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  44.56 
 
 
396 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  40.68 
 
 
387 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  38.44 
 
 
408 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  38.31 
 
 
410 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  36.71 
 
 
415 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  39.49 
 
 
393 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  39.49 
 
 
393 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  40.15 
 
 
390 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  38.54 
 
 
415 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  36.91 
 
 
414 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  35.7 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.02 
 
 
398 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  37.69 
 
 
407 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.38 
 
 
402 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  33.83 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.48 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.32 
 
 
417 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.04 
 
 
405 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.27 
 
 
410 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.32 
 
 
417 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.27 
 
 
407 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.36 
 
 
407 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.36 
 
 
407 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.36 
 
 
407 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.71 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.13 
 
 
405 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.62 
 
 
407 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.27 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.5 
 
 
406 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  33 
 
 
406 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.88 
 
 
399 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.13 
 
 
419 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.13 
 
 
409 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.83 
 
 
411 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  32.91 
 
 
405 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.27 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.59 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.59 
 
 
411 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  39.32 
 
 
404 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  32.84 
 
 
402 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.34 
 
 
411 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.09 
 
 
411 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.41 
 
 
402 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.59 
 
 
407 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.38 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.09 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.09 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.23 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.9 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.69 
 
 
411 aa  190  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.84 
 
 
450 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.88 
 
 
409 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  36.34 
 
 
464 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.94 
 
 
388 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.64 
 
 
400 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.35 
 
 
411 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.08 
 
 
398 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.91 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.49 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.68 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  34.57 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.07 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  35.45 
 
 
398 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.9 
 
 
380 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  33.08 
 
 
412 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  35.31 
 
 
418 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  35.4 
 
 
414 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.44 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  33.76 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.29 
 
 
402 aa  179  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  33.57 
 
 
423 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.83 
 
 
412 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  36.22 
 
 
411 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.92 
 
 
411 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.46 
 
 
417 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.16 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  34.03 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.63 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  34.71 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  32.68 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.48 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  34.62 
 
 
443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  33.51 
 
 
413 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  36.56 
 
 
435 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  35.56 
 
 
447 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.28 
 
 
402 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  34.9 
 
 
423 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  35.56 
 
 
447 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  35.22 
 
 
447 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  35.29 
 
 
399 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  38.29 
 
 
431 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.08 
 
 
411 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.04 
 
 
398 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  35.4 
 
 
444 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>